Problemas com R 2.15
Acabei de instalar o R para Ubuntu e não estou conseguindo instalar nenhum pacote novo, fiz isso para o pacote ncdf, e tentei pra mais alguns e nada todos dão o mesmo erro (achava que era problema com o NetCDF) a mensagem que aparece segue abaixo installing *source* package ‘ncdf’ ... ** package ‘ncdf’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for nc-config... /usr/bin/nc-config configure: creating ./config.status config.status: creating src/Makevars ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include -fpic -O3 -pipe -g -c ncdf.c -o ncdf.o ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directory compilation terminated. make: *** [ncdf.o] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’ * removing ‘/home/tito/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/ncdf’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/Rtmpn8hiQ4/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("ncdf") : installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status Obrigado Tito
Isot é pq o pacote ncdf tem dependencia externas, isto é programas que devem se instalados no seu ubuntu veja na documentacao do pacote o quew vc precisa isntalar no ubuntu antes de instalar o pacote On Wed, 2 May 2012, Tito Conte wrote:
Acabei de instalar o R para Ubuntu e não estou conseguindo instalar nenhum pacote novo, fiz isso para o pacote ncdf, e tentei pra mais alguns e nada todos dão o mesmo erro (achava que era problema com o NetCDF)
a mensagem que aparece segue abaixo
installing *source* package ‘ncdf’ ... ** package ‘ncdf’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for nc-config... /usr/bin/nc-config configure: creating ./config.status config.status: creating src/Makevars ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include -fpic -O3 -pipe -g -c ncdf.c -o ncdf.o ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directory compilation terminated. make: *** [ncdf.o] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’ * removing ‘/home/tito/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/ncdf’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/Rtmpn8hiQ4/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("ncdf") : installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status
Obrigado Tito
Tente rodar no terminal: sudo apt-get build-dep r-cran-ncdf E depois tente instalar de novo. Abs, Daniel On Wed, May 2, 2012 at 4:15 PM, Tito Conte <tito.conte@gmail.com> wrote:
Acabei de instalar o R para Ubuntu e não estou conseguindo instalar nenhum pacote novo, fiz isso para o pacote ncdf, e tentei pra mais alguns e nada todos dão o mesmo erro (achava que era problema com o NetCDF)
a mensagem que aparece segue abaixo
installing *source* package ‘ncdf’ ... ** package ‘ncdf’ successfully unpacked and MD5 sums checked checking for nc-config... /usr/bin/nc-config configure: creating ./config.status config.status: creating src/Makevars ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include -fpic -O3 -pipe -g -c ncdf.c -o ncdf.o ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directory compilation terminated. make: *** [ncdf.o] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’ * removing ‘/home/tito/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/ncdf’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/Rtmpn8hiQ4/downloaded_packages’ Warning message: In install.packages("ncdf") : installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status
Obrigado Tito _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Olá Tite, O problema ocorre porque a biblioteca netcdf não foi encontrada no sistema. Experimente instalar a biblioteca: sudo apt-get install netcdf libnetcdf6 libnetcdf-dev e depois tente instalar o pacote de novo. Espero que ajude, Thiago. --- On Wed, 2/5/12, Tito Conte <tito.conte@gmail.com> wrote: From: Tito Conte <tito.conte@gmail.com> Subject: [R-br] Problemas com R 2.15 To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Date: Wednesday, 2 May, 2012, 20:15 Acabei de instalar o R para Ubuntu e não estou conseguindo instalar nenhum pacote novo, fiz isso para o pacote ncdf, e tentei pra mais alguns e nada todos dão o mesmo erro (achava que era problema com o NetCDF) a mensagem que aparece segue abaixo installing *source* package ‘ncdf’ ...** package ‘ncdf’ successfully unpacked and MD5 sums checkedchecking for nc-config... /usr/bin/nc-config configure: creating ./config.statusconfig.status: creating src/Makevars** libsgcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I/usr/include -fpic -O3 -pipe -g -c ncdf.c -o ncdf.o ncdf.c:3:20: fatal error: netcdf.h: No such file or directorycompilation terminated.make: *** [ncdf.o] Error 1ERROR: compilation failed for package ‘ncdf’* removing ‘/home/tito/R/i686-pc-linux-gnu-library/2.15/ncdf’ The downloaded source packages are in ‘/tmp/Rtmpn8hiQ4/downloaded_packages’Warning message:In install.packages("ncdf") : installation of package ‘ncdf’ had non-zero exit status Obrigado Tito -----Inline Attachment Follows----- _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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Tito Conte