Loop para leitura de picos

19 Dez 2015

      Boa tarde, estou com o seguinte caso:

DADO:
amostra = c(49.936157, 48.133488, 45.775238, 43.229397, 40.021607,
35.927558, 31.365912, 26.849848, 23.233177, 20.770278, 18.572067,
15.590341, 11.936978, 8.478520, 5.572115, 3.272254, 1.642041, 0.999997,
1.473886, 2.616919, 4.169691, 6.464019, 9.790810, 13.820101, 17.978423,
21.674281, 24.065947, 24.875069, 24.590811, 23.620608, 22.240339,
20.676521, 19.088229, 17.689105, 16.720912, 16.358739, 16.792281,
18.321545, 21.053896, 24.777756, 29.121638, 33.551339, 37.628649,
41.272700, 44.405581, 46.899820, 48.602420, 49.253714, 48.816692,
47.380737, 44.920718)
wavelength = seq(400, 450, by=1)
plot(wavelenght, amostra, xlab  = "Comp. Onda (nm)", ylab = 'Valor', type =
"l")
axis(side=1, at=seq(400, 450, by=5))

PROBLEMA:
Estou tentando ler os valores mínimos e máximos de cada pico para ter o
valor da amplitude.
Consigo fazer isso delimitando o intervalo de comp. de ondas da posição do
pico, mas é muito laborioso
EX: max(amostra[,1:20]) e min(amostraamostra[,1:20]). Amplitude seria a
diferença deles.

Para várias amostras tenho utilizado a função apply para dentro da linha,
PORÉM decorrente da heterogeneidade das amostras, as posições variam
causando erro de leitura e modelagem.

Outro fato é que existem inúmeros picos dentro de uma faixa de interesse, e
delimitando visualmente torna-se inviável. Para isso, estou tentando criar
uma rotina que leia todos os picos dentro da faixa de interesse, para que
possa utiliza-los diferentemente nas modelagens.

Tentei o código abaixo, mas me retorna o erro que o argumento é de
comprimento zero!

for(i in 1:length(amostra)){
      if((amostra[i+1] > amostra[i])&(amostra[i-1]>amostra[i]))
       print(amostra[i])
      }

(Error in if ((amostra[i + 1] > amostra[i]) & (amostra[i - 1] >
amostra[i])) print(amostra[i]) : argument is of length zero)

Um resultado que observei foi de do seguinte código, somente com uma
condição colocada nele:

for(i in 1:length(amostra)){
      if(amostra[i+1] > amostra[i])
       print(amostra[i])
  }

Nesse código, consegue-se ler os valores crescentes dos picos,
desconsiderando os valores do objeto quando os valores são decrescentes. A
partir dele que tentei colocar duas condições depois do IF para que ele
lê-se somente os valores mínimos, mas sem sucesso.

Portanto, peço ajuda para confecção de um código que faça a leitura dos min
e max, ou amplitude, de todos os picos da amostra, retornando em um
objeto/dataframe para modelagem.

Grato pela atenção! José Lucas.

José Lucas Safanelli

salah

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