Boa tarde! Estou precisando rodar um programa em R dentro de um programa em Perl. Para isso, estou usando a função *system(CMD R BACH --slave arquivo.R)* do perl, porém, eu precisava que na shell aparecesse as saídas em R, não que apenas ele rodasse sem que eu pudesse ve-las, uma vez que dentro desse programa em R tenho vários avisos importantes para o usuário (se os arquivos foram devidamente importados, e análises realizadas)... Embora eu tenha criado uma log (.Rout) que é aberta no final do R rodar, eu preciso que os avisos tenham saída em tempo real na shell... Alguém tem alguma ideia de como solucionar esse problema? Obrigada, Deisy -- Atenciosamente, Deisy Morselli Gysi Bacharel em Biotecnologia Bacharel em Estatística
Olá, Deisey; Eu faço isso em Linux, mas parece que vc está usando Win. Não me lembro bem e não tenho como testar, porém acho que vc pode fazer system ("R -q -f arquivo.R"); []s e espero ter ajudado. -- Wagner Arbex arbex AT arbex PRO br Sent from my iPhone On 02/07/2013, at 18:43, Deisy Gysi <deisygysi@gmail.com> wrote:
Boa tarde!
Estou precisando rodar um programa em R dentro de um programa em Perl. Para isso, estou usando a função system(CMD R BACH --slave arquivo.R) do perl, porém, eu precisava que na shell aparecesse as saídas em R, não que apenas ele rodasse sem que eu pudesse ve-las, uma vez que dentro desse programa em R tenho vários avisos importantes para o usuário (se os arquivos foram devidamente importados, e análises realizadas)...
Embora eu tenha criado uma log (.Rout) que é aberta no final do R rodar, eu preciso que os avisos tenham saída em tempo real na shell...
Alguém tem alguma ideia de como solucionar esse problema? Obrigada, Deisy
-- Atenciosamente, Deisy Morselli Gysi
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_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
____________________________________________________________________________ Aviso de confidencialidade Esta mensagem da Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa), empresa publica federal regida pelo disposto na Lei Federal no. 5.851, de 7 de dezembro de 1972, e enviada exclusivamente a seu destinatario e pode conter informacoes confidenciais, protegidas por sigilo profissional. Sua utilizacao desautorizada e ilegal e sujeita o infrator as penas da lei. Se voce a recebeu indevidamente, queira, por gentileza, reenvia-la ao emitente, esclarecendo o equivoco. Confidentiality note This message from Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuaria (Embrapa), a government company established under Brazilian law (5.851/72), is directed exclusively to its addressee and may contain confidential data, protected under professional secrecy rules. Its unauthorized use is illegal and may subject the transgressor to the law's penalties. If you are not the addressee, please send it back, elucidating the failure.
Complementando, eu acho que basta vc substituir --slave por -f ou por -q -f -- Wagner Arbex, DSc Bioinformática e Modelagem Matemática e Computacional de Biossistemas http://www.cnpgl.embrapa.br/ Sent from my iPad On 02/07/2013, at 22:01, Wagner Arbex <wagner.arbex@embrapa.br> wrote:
Olá, Deisey;
Eu faço isso em Linux, mas parece que vc está usando Win. Não me lembro bem e não tenho como testar, porém acho que vc pode fazer
system ("R -q -f arquivo.R");
[]s e espero ter ajudado. -- Wagner Arbex arbex AT arbex PRO br
Sent from my iPhone
On 02/07/2013, at 18:43, Deisy Gysi <deisygysi@gmail.com> wrote:
Boa tarde!
Estou precisando rodar um programa em R dentro de um programa em Perl. Para isso, estou usando a função system(CMD R BACH --slave arquivo.R) do perl, porém, eu precisava que na shell aparecesse as saídas em R, não que apenas ele rodasse sem que eu pudesse ve-las, uma vez que dentro desse programa em R tenho vários avisos importantes para o usuário (se os arquivos foram devidamente importados, e análises realizadas)...
Embora eu tenha criado uma log (.Rout) que é aberta no final do R rodar, eu preciso que os avisos tenham saída em tempo real na shell...
Alguém tem alguma ideia de como solucionar esse problema? Obrigada, Deisy
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