PGLS - Phylogenetic Generalized Least Squares

Boa tarde, Gostaria de comparar a variação no acúmulo de N foliar entre duas comunidades vegetais utilizando regressões lineares filogenéticas (PGLS ou OLS). Tal análise foi realizada por Penũelas et al 2011 (tabela 2) ao comparar o acúmulo de nutrientes floiares entre duas comunidades vegetais, uma em Borneo e a outra no Hawaii ( http://www.esajournals.org/doi/abs/10.1890/ES10-00185.1). O pacote CAPER possui a função 'pgls' capaz de rodar esse tipo de análise, entretanto, eu só encontrei exemplos sobre comparações de duas variáveis dentro da mesma comunidade: require(caper) data(shorebird) shorebird <- comparative.data(shorebird.tree, shorebird.data, Species, vcv=TRUE) mod <- pgls(log(Egg.Mass) ~ log(M.Mass), shorebird) summary(mod) Alguém poderia me dar uma luz sobre como fazer isso, mas comparando duas populações? Agradeço imensamente por qualquer ajuda. Abraço Marcelo
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marcelo claro de souza