Diferença resultados agricolae::HSD.test e lsmeas
Pessoal, poque o resultado dos testes HSD.test e lsmeans diferem neste exemplo? O resultado fornecido pelo lsmeas está em acordo com o material de onde tirei esse exemplo e que havia sido rodado no SAS. Já o HSD.test difere tanto no valor das médias estimadas como na significancia. install.packages(c("agricolae",lsmeans")) library(agricolae) library(lsmeans) COVARIANCIA<-read.csv(" https://www.dropbox.com/s/0uvwqnnvsdsvphc/Covariancia.csv?raw=1",head=TRUE) modeloCOVAR<-lm(GANHO~PESOINIC+DIETA,data=COVARIANCIA) anova(modeloCOVAR) HSD.test(modeloCOVAR,"DIETA",console=TRUE) lsmeans(modeloCOVAR,pairwise~DIETA,adjust="tukey") -- ========================================= Fernando Souza Zootecnista, DSc. Produção e Alimentação Animal Celular: (31)99796-8781 (Vivo) E-mail:nandodesouza@gmail.com <e-mail%3Anandodesouza@gmail.com> Lattes: http://lattes.cnpq.br/6519538815038307 Blog: https://producaoanimalcomr.wordpress.com/ ==========================================
Isso acontece porque a lsmeans() usa médias ajustadas para o efeito de peso inicial enquanto que HSD.test() usa as médias amostrais que não são ajustadas. Com a função doBy::LSmeans() pode-se verificar que as médias ajustadas são para um animal hipotético de peso igual a média dos animais do experimento. Quando fizer análise de covariância, o mais correto é usar médias ajustadas. As médias amostrais só serão iguais a média ajustada quando os efeitos dos fatores a serem marginalizados são ortogonais. Esse é o caso do experimento em DBC balanceado onde as médias ajustadas e as médias amostrais são iguais pois o efeito de bloco é ortogonal ao de tratamentos. library(multcomp) library(doBy) lsm <- LSmeans(modeloCOVAR, effect = "DIETA") lsm$K # Média do peso inicial. mean(COVARIANCIA$PESOINIC) # Média do ganho por dieta. aggregate(GANHO ~ DIETA, data = COVARIANCIA, FUN = mean) À disposição. Walmes.
boa noite,estou precisando verificar o efeito linear e quadrático para um modelo usando a lsmeans. Imagina neste exemplo DIETA sendo quantitativo 10, 20 e 30. Como eu poderia programar tal análise usando a lsmeans?Grato Em terça-feira, 31 de janeiro de 2017 13:17:52 BRST, Walmes Zeviani via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: Isso acontece porque a lsmeans() usa médias ajustadas para o efeito de peso inicial enquanto que HSD.test() usa as médias amostrais que não são ajustadas. Com a função doBy::LSmeans() pode-se verificar que as médias ajustadas são para um animal hipotético de peso igual a média dos animais do experimento. Quando fizer análise de covariância, o mais correto é usar médias ajustadas. As médias amostrais só serão iguais a média ajustada quando os efeitos dos fatores a serem marginalizados são ortogonais. Esse é o caso do experimento em DBC balanceado onde as médias ajustadas e as médias amostrais são iguais pois o efeito de bloco é ortogonal ao de tratamentos. library(multcomp) library(doBy) lsm <- LSmeans(modeloCOVAR, effect = "DIETA") lsm$K # Média do peso inicial. mean(COVARIANCIA$PESOINIC) # Média do ganho por dieta. aggregate(GANHO ~ DIETA, data = COVARIANCIA, FUN = mean) À disposição. Walmes. _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo reproduz�vel.
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