Anova fatorial com medidas repetidas (e aninhamento?)

Olá pessoal. Desejo comparar a variável "PC" (variável dependente contínua) entre 3 fatores (variáveis independentes categóricas: rede, ambiente e sensibilidade). Como tenho mais de uma medida para a mesma paisagem, creio que devo fazer uma ANOVA fatorial com medidas repetidas. No entanto, creio que haja um aninhamento entre os níveis da variável "sensibilidade", pois o tipo "sensível" é sempre um subconjunto do tipo "tolerante" (está contido em). Como considero esse aninhamento no teste? Por enquanto, meu código é: resultado=aov(PC ~ rede + ambiente + sensibilidade + Error(factor(paisagem))) paisagem PC rede ambiente sensibilidade 35 238.00 Sim florestal sensivel 35 247.00 Sim florestal tolerante 35 6.76 Sim savanico tolerante 35 228.00 Não florestal sensivel 35 228.00 Não florestal tolerante 35 5.15 Não savanico tolerante 36 113.00 Sim florestal sensivel 36 123.00 Sim florestal tolerante 36 144.00 Sim savanico sensivel 36 160.00 Sim savanico tolerante 36 87.50 Não florestal sensivel 36 87.50 Não florestal tolerante 36 127.00 Não savanico sensivel 36 127.00 Não savanico tolerante Obrigada. ----------------------------- Thallita Grande, M.Sc. Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D

Thallita, O excerto dos seus dados mostra que (pelo menos para o R) o fator sensibilidade tem dois níveis: *sensível* e *tolerante*. Escrevendo de outra forma um caso ou é sensível ou é tolerante. Então: o quê você quiz dizer com a expressão "subconjunto de"? On Thu, Oct 11, 2018 at 10:22 PM Thallita Grande por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá pessoal.
Desejo comparar a variável "PC" (variável dependente contínua) entre 3 fatores (variáveis independentes categóricas: rede, ambiente e sensibilidade).
Como tenho mais de uma medida para a mesma paisagem, creio que devo fazer uma ANOVA fatorial com medidas repetidas. No entanto, creio que haja um aninhamento entre os níveis da variável "sensibilidade", pois o tipo "sensível" é sempre um subconjunto do tipo "tolerante" (está contido em).
Como considero esse aninhamento no teste?
Por enquanto, meu código é:
resultado=aov(PC ~ rede + ambiente + sensibilidade + Error(factor(paisagem)))
*paisagem* *PC* *rede* *ambiente* *sensibilidade* 35 238.00 Sim florestal sensivel 35 247.00 Sim florestal tolerante 35 6.76 Sim savanico tolerante 35 228.00 Não florestal sensivel 35 228.00 Não florestal tolerante 35 5.15 Não savanico tolerante 36 113.00 Sim florestal sensivel 36 123.00 Sim florestal tolerante 36 144.00 Sim savanico sensivel 36 160.00 Sim savanico tolerante 36 87.50 Não florestal sensivel 36 87.50 Não florestal tolerante 36 127.00 Não savanico sensivel 36 127.00 Não savanico tolerante
Obrigada.
----------------------------- *Thallita Grande, M.Sc.* Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

Olá Cesar. Os meus dados dizem respeito a configurações espaciais de redes em paisagens. Quando eu falei em "subconjunto", quis dizer que, espacialmente, o grupo "sensível" está contido dentro do grupo "tolerante". Mas de fato são níveis independentes, ou seja, ou é sensível ou é tolerante. Explicando mais um pouco: eu gerei a variável dependente "PC" quatro vezes, em cada dos seguintes grupos: florestal-sensível, florestal-tolerante, savânico-sensível, savânico-tolerante. Será que estou enganada quanto à possibilidade de aninhamento? ----------------------------- Thallita Grande, M.Sc. Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D ________________________________ De: R-br <r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br> em nome de Cesar Rabak por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Enviado: domingo, 14 de outubro de 2018 19:55:36 Para: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. Cc: Cesar Rabak Assunto: Re: [R-br] Anova fatorial com medidas repetidas (e aninhamento?) Thallita, O excerto dos seus dados mostra que (pelo menos para o R) o fator sensibilidade tem dois níveis: sensível e tolerante. Escrevendo de outra forma um caso ou é sensível ou é tolerante. Então: o quê você quiz dizer com a expressão "subconjunto de"? On Thu, Oct 11, 2018 at 10:22 PM Thallita Grande por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br>> wrote: Olá pessoal. Desejo comparar a variável "PC" (variável dependente contínua) entre 3 fatores (variáveis independentes categóricas: rede, ambiente e sensibilidade). Como tenho mais de uma medida para a mesma paisagem, creio que devo fazer uma ANOVA fatorial com medidas repetidas. No entanto, creio que haja um aninhamento entre os níveis da variável "sensibilidade", pois o tipo "sensível" é sempre um subconjunto do tipo "tolerante" (está contido em). Como considero esse aninhamento no teste? Por enquanto, meu código é: resultado=aov(PC ~ rede + ambiente + sensibilidade + Error(factor(paisagem))) paisagem PC rede ambiente sensibilidade 35 238.00 Sim florestal sensivel 35 247.00 Sim florestal tolerante 35 6.76 Sim savanico tolerante 35 228.00 Não florestal sensivel 35 228.00 Não florestal tolerante 35 5.15 Não savanico tolerante 36 113.00 Sim florestal sensivel 36 123.00 Sim florestal tolerante 36 144.00 Sim savanico sensivel 36 160.00 Sim savanico tolerante 36 87.50 Não florestal sensivel 36 87.50 Não florestal tolerante 36 127.00 Não savanico sensivel 36 127.00 Não savanico tolerante Obrigada. ----------------------------- Thallita Grande, M.Sc. Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

Parece que os níveis todos são independentes e o seu fatorial é completo com repetições. Sua chamada a anova parece OK e refletir isso. On Mon, Oct 15, 2018 at 9:33 AM Thallita Grande por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá Cesar.
Os meus dados dizem respeito a configurações espaciais de redes em paisagens. Quando eu falei em "subconjunto", quis dizer que, espacialmente, o grupo "sensível" está contido dentro do grupo "tolerante". Mas de fato são níveis independentes, ou seja, ou é sensível ou é tolerante. Explicando mais um pouco: eu gerei a variável dependente "PC" quatro vezes, em cada dos seguintes grupos: florestal-sensível, florestal-tolerante, savânico-sensível, savânico-tolerante.
Será que estou enganada quanto à possibilidade de aninhamento?
----------------------------- *Thallita Grande, M.Sc.* Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D ------------------------------ *De:* R-br <r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br> em nome de Cesar Rabak por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> *Enviado:* domingo, 14 de outubro de 2018 19:55:36 *Para:* a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. *Cc:* Cesar Rabak *Assunto:* Re: [R-br] Anova fatorial com medidas repetidas (e aninhamento?)
Thallita,
O excerto dos seus dados mostra que (pelo menos para o R) o fator sensibilidade tem dois níveis: *sensível* e *tolerante*.
Escrevendo de outra forma um caso ou é sensível ou é tolerante.
Então: o quê você quiz dizer com a expressão "subconjunto de"?
On Thu, Oct 11, 2018 at 10:22 PM Thallita Grande por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá pessoal.
Desejo comparar a variável "PC" (variável dependente contínua) entre 3 fatores (variáveis independentes categóricas: rede, ambiente e sensibilidade).
Como tenho mais de uma medida para a mesma paisagem, creio que devo fazer uma ANOVA fatorial com medidas repetidas. No entanto, creio que haja um aninhamento entre os níveis da variável "sensibilidade", pois o tipo "sensível" é sempre um subconjunto do tipo "tolerante" (está contido em).
Como considero esse aninhamento no teste?
Por enquanto, meu código é:
resultado=aov(PC ~ rede + ambiente + sensibilidade + Error(factor(paisagem)))
*paisagem* *PC* *rede* *ambiente* *sensibilidade* 35 238.00 Sim florestal sensivel 35 247.00 Sim florestal tolerante 35 6.76 Sim savanico tolerante 35 228.00 Não florestal sensivel 35 228.00 Não florestal tolerante 35 5.15 Não savanico tolerante 36 113.00 Sim florestal sensivel 36 123.00 Sim florestal tolerante 36 144.00 Sim savanico sensivel 36 160.00 Sim savanico tolerante 36 87.50 Não florestal sensivel 36 87.50 Não florestal tolerante 36 127.00 Não savanico sensivel 36 127.00 Não savanico tolerante
Obrigada.
----------------------------- *Thallita Grande, M.Sc.* Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.

Oi Cesar. Na verdade, acho que os níveis da variável sensibilidade não são independentes. Pois os níveis "sensível" e "tolerante" foram caracterizados de forma diferente para o grupo florestal e savânico. É como se eu tivesse 4 níveis distintos dentro da variável sensibilidade, dois relativos ao nível savânico e dois relativos ao nível florestal, da variável "tipo". Estudando sobre aninhamento, encontrei essa possibilidade: modelo <- aov(PC ~ Rede * ambiente/sensibilidade + Error(paisag), data=data) Mas estou com dúvida se expresso o aninhamento dessa forma, ou dentro do "Error", como por exemplo algo assim: modelo <- aov(PC ~ Rede * ambiente * sensibilidade + Error(paisag/sensibilidade), data=data) Agradeço qualquer elucidação. ----------------------------- Thallita Grande, M.Sc. Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D ________________________________ De: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> Enviado: terça-feira, 16 de outubro de 2018 00:59:24 Para: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. Cc: Thallita Grande Assunto: Re: [R-br] Anova fatorial com medidas repetidas (e aninhamento?) Parece que os níveis todos são independentes e o seu fatorial é completo com repetições. Sua chamada a anova parece OK e refletir isso. On Mon, Oct 15, 2018 at 9:33 AM Thallita Grande por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br>> wrote: Olá Cesar. Os meus dados dizem respeito a configurações espaciais de redes em paisagens. Quando eu falei em "subconjunto", quis dizer que, espacialmente, o grupo "sensível" está contido dentro do grupo "tolerante". Mas de fato são níveis independentes, ou seja, ou é sensível ou é tolerante. Explicando mais um pouco: eu gerei a variável dependente "PC" quatro vezes, em cada dos seguintes grupos: florestal-sensível, florestal-tolerante, savânico-sensível, savânico-tolerante. Será que estou enganada quanto à possibilidade de aninhamento? ----------------------------- Thallita Grande, M.Sc. Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D ________________________________ De: R-br <r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:r-br-bounces@listas.c3sl.ufpr.br>> em nome de Cesar Rabak por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br>> Enviado: domingo, 14 de outubro de 2018 19:55:36 Para: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. Cc: Cesar Rabak Assunto: Re: [R-br] Anova fatorial com medidas repetidas (e aninhamento?) Thallita, O excerto dos seus dados mostra que (pelo menos para o R) o fator sensibilidade tem dois níveis: sensível e tolerante. Escrevendo de outra forma um caso ou é sensível ou é tolerante. Então: o quê você quiz dizer com a expressão "subconjunto de"? On Thu, Oct 11, 2018 at 10:22 PM Thallita Grande por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br>> wrote: Olá pessoal. Desejo comparar a variável "PC" (variável dependente contínua) entre 3 fatores (variáveis independentes categóricas: rede, ambiente e sensibilidade). Como tenho mais de uma medida para a mesma paisagem, creio que devo fazer uma ANOVA fatorial com medidas repetidas. No entanto, creio que haja um aninhamento entre os níveis da variável "sensibilidade", pois o tipo "sensível" é sempre um subconjunto do tipo "tolerante" (está contido em). Como considero esse aninhamento no teste? Por enquanto, meu código é: resultado=aov(PC ~ rede + ambiente + sensibilidade + Error(factor(paisagem))) paisagem PC rede ambiente sensibilidade 35 238.00 Sim florestal sensivel 35 247.00 Sim florestal tolerante 35 6.76 Sim savanico tolerante 35 228.00 Não florestal sensivel 35 228.00 Não florestal tolerante 35 5.15 Não savanico tolerante 36 113.00 Sim florestal sensivel 36 123.00 Sim florestal tolerante 36 144.00 Sim savanico sensivel 36 160.00 Sim savanico tolerante 36 87.50 Não florestal sensivel 36 87.50 Não florestal tolerante 36 127.00 Não savanico sensivel 36 127.00 Não savanico tolerante Obrigada. ----------------------------- Thallita Grande, M.Sc. Doutorado em Ecologia Instituto de Ciencias Biologicas Universidade de Brasilia - Campus Darcy Ribeiro Skype: thallita.grande CRBio 080256/04-D _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br<mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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