Se forem k-1 (k=número de níveis de um fator) contrastes ortogonais, você desdobrar dentro do quadro de anova conforme tem-se nessa página
http://www.leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/ciaeear/ciaeear_08fat.htmlPara outros casos, tem-se outras abordagens. Bem, na minha opinião, mesmo que seja para fins didáticos, eu não posso deixar de expressar minha preocupação com o fato de as pessoas insistirem tentar fazer o R reproduzir o que outros aplicativos fazem tomando esses aplicativos como padrão ouro/referência sem antes parar para pensar se aquilo faz sentido. Não estou dizendo que o seu caso não faça sentido, ok?
À disposição.Walmes.
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