Caros usuários de R, minha dúvida na verdade é mais sobre estatística do que o R em si. Estou utilizando uma ANOVA de medidas repetidas com três fatores sendo que há repetição somente para dois destes fatores. O código e o resultado que estou obtendo segue o modelo abaixo:

> summary(aov(dependente ~ fator1 * fator2 * fator3 + 
+ Error(individuo/(fator2 * fator3))))

Error: individuo
                Df   Sum Sq   Mean   Sq   F value   Pr(>F)
fator1        1       80616      80616        0.260     0.645
fator2        1      809787     809787       2.611     0.205
Residuals  3      930281     310094               

Error: individuo:fator2
                   Df   Sum Sq    Mean Sq     F value   Pr(>F)
fator2            2     181649      90824        1.491     0.282
fator1:fator2   2    186811       93405        1.533     0.273
Residuals      8     487309      60914               

Error: individuo:fator3
                   Df   Sum Sq   Mean Sq   F value    Pr(>F)   
fator3            2   474691    237345     14.526    0.00502 **
fator1:fator3   2   138023     69012      4.224     0.07163 . 
fator2:fator3   2   184239     92120      5.638     0.04189 * 
Residuals      6    98035     16339                   
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

Error: individuo:fator2:fator3
                     Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
fator2:fator3         4  58378   14594   0.374  0.824
fator1:fator2:fator3  4 198072   49518   1.270  0.323
Residuals            16 624020   39001               

Error: Within
                Df    Sum Sq   Mean Sq   F value   Pr(>F)
Residuals  51   2676429     52479     

Todas as cinco tabelas são imprescindíveis para fins de avaliar o efeito dos fatores sobre a variável dependente? Como diferencio o que cada uma expõe? Por exemplo, o resultado da primeira tabela indica o efeito dos fatores 1 e 2 isoladamente ao retirar o efeito dos indivíduos? Qual a diferença entre os resultados expostos para o fator2 na primeira e na segunda tabela?

Desde já, muito obrigado pela atenção.

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Roberto Guevara Ferreira Lima

Biólogo - CRBio 6ª Região: 73146/06-D
Mestre em Zoologia
Laboratório de Ecologia e Zoologia de Vertebrados
Instituto de Ciências Biológicas
Universidade Federal do Pará
Rua Augusto Corrêa, nº 01 - Bairro: Guamá. CEP: 66075-110
Currículo Lattes: http://lattes.cnpq.br/7363382159007600