Yury,

A alternativa mais conveniente para ler arquivos netcdf no R é usar o pacote "raster", pois o objeto resultante já é um "mapa", inclusive geo-referenciado quando é o caso. 

Caso o arquivo que você precisa ler tenha apenas uma camada, por exemplo, um mapa de vegetação ou coisa parecuda, basta fazer isso:

r <- raster("caminho-do-seu-arquivo")

plot(r)

Caso o seu arquivo seja multi-camadas (por exemplo a saída de algum modelo climático com várias datas no mesmo arquivo), é melhor ler o arquivo como um raster brick:

b <- brick("caminho-do-seu-arquivo")

plot(b,1) # plota a primeira camada do objeto

Outra dica: se você precisa apenas visualizar rapidamente o conteúdo do arquivo, é melhor usar o ncview ou o Panoply.

 

Hope this helps,

 -- Thiago V. dos Santos

PhD student

Land and Atmospheric Science

University of Minnesota

On Wednesday, February 10, 2016 10:56 AM, Yury Duarte <yurynepomuceno@gmail.com> wrote:

Boa tarde colegas programadores!

Estou com alguns problemas em trabalhar com arquivos de extensão .nc.

Acredito que esses são arquivos do tipo raster.

Baixei os pacotes ncdf4; ncdf.tools e o RNetCDF.

Com nenhum desses pacotes consegui fazer a leitura do arquivo, até o momento.

Estou selecionando o diretório de onde irei buscar os arquivos .nc e em seguida uso o comando library() para instalar um dos três pacotes que mencionei acima.

Feito isso, o próximo passo sugerido pelo R é usar um comando open.nc/open.ncdf (dependendo do pacote escolhido), entretanto o R não reconhece os comandos open.

Alguém tem familiaridade com esse tipo de arquivo e pode me dar uma ajuda nessa questão?

Desde já, agradeço pela disponibilidade de todos!

Abs

Yury Duarte

Engenheiro Agrônomo - ESALQ/USP

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