mude brewer.pal(9,"Blues") para rev(brewer.pal(9,"RdBu")) b Em 18 de setembro de 2014 12:00, Thiago V. dos Santos < thi_veloso@yahoo.com.br> escreveu:
Caro Wenceslau,
Também estou buscando mudar a escala de cores para algo mais didático, mas ainda não acertei totalmente as configurações. Por enquanto, o que estou fazendo é:
# criar uma escala de azul usando o RColorBrewer. # digite display.brewer.all() para ver as paletas disponíveis cols <- colorRampPalette(brewer.pal(9,"Blues"))(200)
# plotar o perfil especificando a paleta no argumento "cols" plot <- filled.contour(x= date, y= sort(-(as.numeric(names(depths)))), z= t(soil_data[11:1,]), zlim= c(0,1), ylab= expression(theta(m^3~~m^-3)), col=cols, nlevels= 100)
Ainda não é o ideal, mas pelo menos uma escala azul torna mais fácil a interpretação de diferentes quantidades de umidade no solo.
Saudações, -- Thiago V. dos Santos PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/inde... Phone: (612) 323 9898
On Thursday, September 18, 2014 9:46 AM, Wenceslau Teixeira < wgt007@gmail.com> wrote:
Caros colegas do R,
muito bacana o script disponibilizado para traçar os perfis de umidade do solo. Será útil para nós. Só gostaria de trocar as cores, com valores mais alto (umido) para azul e valores mais baixos (solo seco) para vermelho, assim o gráfico fica mais cognitivo. Alguém sabe como mudar as cores ?
Cordialmente,
Wenceslau Teixeira Embrapa Solos
library(repmis) # reads text data directly from dropbox - no need to download any file # read data url <- 'https://dl.dropboxusercontent.com/u/27700634/precip.txt' tmp <- repmis::source_data(url, sep = '', header = TRUE)
# convert julian day to date date <- as.Date(tmp$julian, origin='2011-12-31') data <- cbind(date, tmp) head(data) # define vector with depth of soil layers depths <- c(0.05,0.10,0.20,0.30, 0.40,0.60,0.80,1.00, 1.50,2.00,2.50)
# teste com lattice cols <- ncol(data):4 levelplot(as.matrix(data[, cols]), aspect = "fill", xlab = "date", ylab = "soil Moist.", scales = list(x = list(at = which(date %in% pretty(date)), labels = pretty(date)), y = list(at = length(cols):1, labels = depths)), contour = T)
# Plot soil moisture profile
# como são profundidades (abaixo da superfície) use a convenção de z negativo # acrescentei a chuva, precisa ajustar ylabels, mtext() resolve
x11() op <- par(mar = c(3,4,12,3)) plot <- filled.contour(date, sort(-depths), as.matrix(data[, cols]), ylab = expression(theta(m^3~~m^-3))) par(new=T,mar=c(23,4,1,8)) with(data, plot(date, precip, type = "h", xaxt = "n", xpd = T, xaxs="i", ylab = "Precip (mm)", xlab = "")) par(op)
--
Wenceslau Teixeira
wgt007@gmail.com skype: wgt007
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