Olá Thiago,
Desculpa. Sou nova aqui neste fórum e não sabia a maneira mais correta de expor a minha dúvida.
Talvez eu deva contextualizar, antes de tudo, melhor o caso de uma das minhas planilhas.
Abaixo exponho-lhe parte da minha planilha:
| Abu sp | Abu vai | Aca bi |
| AS-A-C | 0 | 0 | 0 |
| AS-A-D | 1 | 0 | 0 |
| AS-B-A | 1 | 0 | 1 |
| AS-B-B | 0 | 0 | 0 |
| AS-B-C | 0 | 0 | 0 |
| AS-B-D | 0 | 0 | 0 |
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As linhas da primeira coluna correspondem às minhas estações de amostragens (AS-A-C, etc). Já a primeira linha da 2 a 3 coluna corresponde ao nome das minhas espécies estudadas (Abu sp, etc), com suas respectivas abundâncias para cada estação de coleta.
Para importar esta planilha eu usei tanto a função read.csv() quanto read.table() e read.delim().
No caso da função read.csv usei os argumentos básicos (sep=";" e header=T). A mesma coisa fiz báscimanete com o read.table.
Para função read.delim() eu descobri que, se eu acrescentar o argumento check.names=FALSE, eu consigo importar a planilha da forma desejada.
Isto é, obtenho um data.frame na forma de tabela de contingência sem o ''X'' no lugar da primeira célula.
O problema, contudo, é que dessa forma o R interpreta minha primeira coluna como sendo um fator com 23 níveis. Eu preciso que as estações também sejam interpretadas como um cabecalho. Se, por exemplo, você der um View(aravo$spe - exemplo do pacote ade4), observe que as estações de coleta constam como cabecalho (as linhas não estão enumeradas).
No meu caso, como o R lê a minha primeira linha como um fator, quando dou um View() da minha planilha, minhas linhas estão enumeradas e só depois delas é que começa a planilha.
No caso quando eu uso a função ftable() do pacote stats, aparece a seguinte mensagem de erro:
Error in table(x, exclude = exclude) :
attempt to make a table with >= 2^31 elements
E quando eu uso a função read.xls() do pacote gdata, o seguinte erro aparece:
Error in findPerl(verbose = verbose) :
perl executable not found. Use perl= argument to specify the correct path.
Error in file.exists(tfn) : invalid 'file' argument
Eu já tentei modificar esse argumento "perl", mas de nada adiantou.
Bom, não sei se consegui ser clara o suficiente desta vez. Caso não, posso tentar detalhar mais e inclusive te enviar a minha planilha para dar uma olhada.
Desde já muito obrigada pela sua atenção
Date: Mon, 15 Feb 2016 12:03:25 -0200
From: thiago.serafim@gmail.com
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Importação de planilha de contingência
Olá Marie.
É difícil te ajudar se você não fornecer algumas informações básicas.
"Sempre que importo, o R atribui um ''X'' no lugar da primeira célula da minha planilha, aonde, contudo, não deveria constar nada."
Que função você usou para "importar" o arquivo? Com quais argumentos? Tentou usar outros argumentos? Quais?
"Já tentei usar a função ftable() e read.xls(), mas não consegui aplicá-las."
Não conseguiu aplicar porque? O que acontece? Também aparece X na primeira célula? Ocorre um erro? Se sim, qual a mensagem?
Quais pacotes você está usando? Quando executo read.xls(), recebo a mensagem "Error: could not find function "read.xls""
Acho que esse é um bom começo.
Atenciosamente,
Thiago
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