Bom dia Pessoal,

            Continuando a discussão sobre a função model.matrix() eu gostaria de tentar utilizar o objeto criado por model.matrix() (Treat.ortho <- model.matrix(~-1+dados$avaliacao)) no CRM abaixo para criar contrastes entre os três níveis de um tratamento, mas a função contrasts() não funciona diretamente e não quero que ter que especificar via cbind(c(0,1,0),c(0,0,1)), ou seja, gostaria de criar um método que operacionalizasse todos os contrastes em função dos níveis informados sendo:

#Dados artificiais
colony<-as.factor(sort(rep(c("colony1", "colony2","colony3"), 100)))
y1 <- c(rnorm(100,1,0.1),rnorm(100,5,0.1),rnorm(100,3.5,0.1))
y2 <- c(rnorm(100,10,0.3),rnorm(100,11,0.6),rnorm(100,5,0.6))
y3 <- c(rnorm(100,10,2.3),rnorm(100,11,2.6),rnorm(100,11,2.5))
y4 <- c(rnorm(100,5,0.5),rnorm(100,7,0.5),rnorm(100,22,0.5))
y5 <- c(rnorm(100,11,0.1),rnorm(100,11,0.1),rnorm(100,11,0.1))


#Cria o data frame
avaliacao <- as.factor(colony)
espectro <- cbind(y1,y2,y3,y4,y5)
dados <- data.frame(avaliacao = I(as.matrix(avaliacao)), bands = I(as.matrix(espectro)))


## Cria uma matriz de contraste
##Niveis
levels(avaliacao)

Treat.ortho <- model.matrix(~-1+dados$avaliacao)

 
## Cria um fator para cada contraste
col1vs2 <- 
col1vs3 <-   

   Aqui não sei como fazer isso?

Obrigado,

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Alexandre dos Santos
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On 24/02/2015 15:02, walmes . wrote:
Até onde sei, a partir de um fator não tem como você dizer para a model.matrix() que você quer remover colunas durante a construção. O mais fácil parece ser construir a matriz e remover o não desejado. Como as colunas tem nomes fica fácil remover a partir deles.

À disposição.
Walmes.


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