Prezado Rodolfo... executando no terminal o comando

./configure --with-blas --with-lapack --with-readline --with-tcltk --with-cairo --with-libpng --with-jpeglib --with-libtiff LI64=lib --enable-R-shlib --prefix=/usr

a resposta foi

diretório inexistente.


Prezado Marcelo... adicionando o repositório

deb http://cran.fiocruz.br/bin/linux/debian buster-cran35/
obtive o mesmo erro anterior adicionado de uma mensagem falando sobre uma chave pública.

Tentei variações como
deb http://cran.fiocruz.br/bin/linux/debian bionic-cran35/
deb http://cran.fiocruz.br/bin/linux/ubuntu buster-cran35/
deb http://cran.fiocruz.br/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/
deb https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu buster-cran35/
deb https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/
deb https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/debian buster-cran35/
deb https://cran-r.c3sl.ufpr.br/bin/linux/debian bionic-cran35/

Continua com mesmo erro.

Alguma idéia do que pode estar errado?

Obrigado pela atenção.

Emerson


Em sex., 28 de fev. de 2020 às 17:43, Emerson Cotta Bodevan <bodevan.ec@gmail.com> escreveu:
Prezados Rodolfo e Marcelo, boa tarde.

Obrigado pelas dicas. Vou tentar resolver utilizando-as.

Postarei aqui como consegui resolver.

Obrigado mais uma vez.

Emerson


Em qui., 27 de fev. de 2020 às 20:52, Rodolfo Silva por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:

Misturar repositório de distros distintas (Debian -> Ubuntu -> Mint) não é uma boa idéia.

Quanto ao uso do comando como root, se da na necessidade em se ter permissão de escrita no diretório /usr/lib/R/library enquanto o usuário grava apenas em ~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.X/ evitando qualquer tipo de conflito, tendo dois ambientes de bibliotecas. Até então não tive problemas. Atualmente migrei de Debian para Arch e permanece funcionando satisfatoriamente.

Atenciosamente

Em 27/02/2020 18:11, Marcelo Laia escreveu:
Uma vez, na lista de discussão do R-USER eu fui recomendado não utilizar os comandos update.packages e install.packages no modo root. Desde então, não utilizo.

O amigo já tentou os repositórios oficiais do CRAN para Debian?

Por exemplo:


Basta inserir o item abaixo no /etc/apt/sources.list

deb http://<favourite-cran-mirror>/bin/linux/debian buster-cran35/

E substituir "<favourite-cran-mirror>" por  "https://cran.fiocruz.br/bin/linux" sem as aspas.

Para mais detalhes, visite:


Laia ML
Adicionei o repositório



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