Ola pessoal. Estou aqui ainda muito confuso com o que estou fazendo.
Augusto,
Com a função aov() você não está apropriadamente ajustando um modelo para contemplar as medidas repetidas. A aov() implica em uma estrutura simétrica composta. É mais realista usar uma estrutura de covariância entre as observações na qual a correlação diminua com o intervalo de separação (temporal, espacial). Você pode ajustar um modelo linear assim com a nlme::gls() declarando alguma estrutura de correlação para o argumento correlation= dessa função. Veja ?corClasses. Para aplicar o teste você pode usar a gmodels::estimable(), gmodels::fit.contrast(), contrast::contrast(), multcomp::glht(). Não tenho certeza se todas tem métodos para objetos da classe gls. Uma pergunta para estimular o pensamento: se você pode assumir que a correlação diminui continuamente com o intervalo de tempo, para quê fazer teste de média se você pode também modelar a sua resposta como uma função contínua no tempo?
À disposição.
Walmes.
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Walmes Marques Zeviani
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