Obrigado pelas dicas Walmes. E aproveito para fazer mais duas perguntas. 

Para aplicar a abordagem de modelos mistos para o exemplo que enviei o efeito aleatório deveria ser Parcela/Sub-parcela?

Com os artifícios presentes no tutorial que você me indicou eu consigo ajustar o efeito de cada uma das testemunhas já que cada 

uma delas pertence a um extrato (temperatura) específico.

Desde já agradeço pela ajuda.

Att.

Tiago.   

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Tiago de Souza Marçal - Engenheiro Agrônomo pelo CCA-UFES
 
Mestrando em Genética e Melhoramento de Plantas
 
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Date: Tue, 14 Jul 2015 00:41:01 -0300
From: walmeszeviani@gmail.com
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Parcelas sub-divididas com fatorial nas parcelas

Veja os html nesse endereço http://www.leg.ufpr.br/~walmes/tutorial/ para exemplos de análise de fatorial duplo com dois tratamentos adicionais (que também servem para um adicional). A análise do fatorial triplo vai seguir a mesma ideia, no entanto, como você tem dois estratos, o jeito mais fácil de acomodar isso é com modelo misto, nlme::lme() ou lme4::lmer(). aov() também pode ser usado mas eu não encorajo pela escassez de métodos disponíveis para a classe aovList e supor experimento regular/balanceado.

À disposição.
Walmes.

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