Alexandre,

Salvo se eu me perdi na leitura do seu texto e na sua função, basta você decidir o quê você vai colocar nas células da matriz quando os valores não estiverem como você deseja e usar um teste if com cláusula else nas atribuições, ou uma construção similar à que você já faz para determinar se vai escrever na diagonal superior ou inferior com seus vetores above1 e above2.

HTH 

2015-08-16 23:50 GMT-03:00 ASANTOS <alexandresantosbr@yahoo.com.br>:
Prezados listeiros,

    No meu CRM abaixo tenho uma matriz de correlação com o valor de p na diagonal superior o e valor r de Pearson da diagonal inferior, no entanto eu gostaria de exibir uma matriz de correlação apenas com os p valores maiores ou igual 0.05 e r maior ou igual a 0.08 isso é possível?

Segue CRM:

require(Hmisc)## Pacote

#Variáveis artificiais
var1<-sort(rnorm(500,1), decreasing = TRUE)
var2<-rnorm(500,10)
var3<-sort(rnorm(500,22))
var4<-sort(rnorm(500,10))
var5<-sort(rnorm(500,0.5), decreasing = TRUE)
var6<-sort(rnorm(500,25), decreasing = TRUE)
var7<-rnorm(500,10)
dados<-cbind(var1,var2,var3,var4,var5,var6,var7)

#Função que dispõem p valor na diagonal superior e r valor na inferior

pn <- function(X){crossprod(!is.na(X))}

cor.prob <- function(X){
    pair.SampSize <- pn(X)
    above1 <- row(pair.SampSize) < col(pair.SampSize)
    pair.df <- pair.SampSize[above1] - 2
    R <- cor(X, use="pair")
    above2 <- row(R) < col(R)
    r2 <- R[above2]^2
    Fstat <- (r2 * pair.df)/(1 - r2)
    R[above2] <- 1 - pf(Fstat, 1, pair.df)
    R
}

#Resultado da matriz
cor.prob(dados)
#

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Alexandre dos Santos
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