Caro Gleyson,
Seja benvindo à lista R-br!
Você terá mais chances de receber uma reposta útil se ao postar nesta lista você colocar uma linha de assunto relevante ao problema/questão que deseja esclarecer.
Ajuda bastante se você fornecer mais informações, como por exemplo que comando efetivamente foram dados e se possível fazê-lo com um CMR (código mínimo reproduzível).
Seu depoimento sobre o tamanho da matriz também me parece confuso: "...para calcular sendo que existem mais de 100 animais...matriz so é
calculada quando o numero de indivíduos e menor que 999 animais."
Você já tentou usar as ferramentas de busca do próprio R?
[]s
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Cesar Rabak