Ludmila,

Por que o seu código não funciona? Aqui no meu computador funcionou com um raster aleatório.

Você tentou usar a função clump? Ela pode ser mais próxima do que você precisa. Veja abaixo:

library(raster)

library(igraph)

# Create random raster

r <- raster(ncols=12, nrows=12)

set.seed(0)

r[] <- round(runif(ncell(r))*0.7 )

# Detect clumps and plot result

rc <- clump(r)

plot(rc)

# Extract coordinates

xy <- coordinates(rc)

lon <- xFromCol(r,1:ncol(r))

lat <- yFromRow(r,1:nrow(r))

Se o código acima não funcionar no seu computador, por favor retorne a mensagem de erro E o raster que você está usando para que a lista possa ajudar.

 

Saudações,
--
Thiago V. dos Santos
PhD student
Land and Atmospheric Science
University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm
Phone: (612) 323 9898

---

From: Ludmila Rattis <ludmilarattis@gmail.com>
To: R-br@listas.c3sl.ufpr.br
Sent: Tuesday, August 20, 2013 1:54 PM
Subject: [R-br] get coordinates of patches (clumps) in a raster map

Prezados,

Preciso extrair as coordenadas dos centroides de diferentes clumps de um raster. Para isso, usei o seguinte código: 

p <- data.frame(rasterToPoints(meu_raster))

a<- p[p$layer > 0,]

c<-sapply(split(p[, c("x", "y")], p$layer), colMeans)

Contudo, esse código não está funcionando.

Alguém saberia me dizer como posso obter tais coordenadas?

[]'s

Ludmila Rattis

Programa de Pós-graduação em Ecologia/UNICAMP
Conservation Biogeography Lab
http://www.wix.com/rdloyola/lab

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