Marcelo,

Os contrastes são na escala do preditor linear e não na escala da resposta. Contrastes entre níveis do fator é por exemplo, se um fator A tem níveis a1, a2 e a3, você vai fazer contrastes envolvendo esses níveis. O procedimento chama de comparação múltipla de médias é um caso particular de aplicação de contrastes quando você faz todos os contrastes 2 à 2 possíveis entre os níveis. A opção type="average" faz com você compare níveis do fator A na média dos níveis do fator B, coisa que só faz sentido na ausência de interação, lógico. Veja o vignette do pacote http://cran.r-project.org/web/packages/contrast/vignettes/contrast.pdf.

À disposição.
Walmes.

==========================================================================
Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
fone: (+55) 41 3361 3573
VoIP: (3361 3600) 1053 1173
e-mail: walmes@ufpr.br
twitter: @walmeszeviani
homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
linux user number: 531218
==========================================================================