Caro Elias,
De fato o número grande de registros permite que eventuais correlações não importantes do ponto de vista do domínio do problema tornem-se estatisticamente "significantes".
Não é um "problema" que possa ser resolvido por meio da matemática, mas sim do raciocínio no domínio do problema.
Em alguns casos (especialmente em metaanálise) a tendência pode levar a uma descoberta como foi o famoso caso do ácido acetilsalicílico ligado a doenças cardíacas, enquanto noutros casos pode levar a interpretações do tipo "folhas de chá" como nos inúmeros pseudo estudos de "provas" da existência de fenômenos paranormais, etc.
Somente o raciocínio crítico e o corpo de conhecimento no assunto que você estuda poderão ajudá-lo a encontrar a resposta adequada.
HTH
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Cesar Rabak