como demorei demais, imagino que já deve ter solucionado, mas em caso contrario
fica alguns comandos para inspirar a solução do problema


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# tente pegar a lista de arquivos com o comando dir
#arqs <- dir(pattern='*.hdf')
arqs <- c("S20040012004031.hdf", "S20040322004060.hdf")

# d1 <- as.numeric(gsub( 'S2004(...)2004(...)\\.hdf','\\1', arqs[2] ))
  d2 <- as.numeric(gsub( 'S2004(...)2004(...)\\.hdf','\\2', arqs[2] ))

# descobre qual é o mês correspondente (em numero de 1 a 12)
mes_number <- table((d2 - 30*(1:12)+5>0))[2], sep='')

nome <- paste('mes', '04',  sprintf("%02.0f", mes_number), sep='')
assign( nome,  'alguma coisa a ser salva' )
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qualquer duvido, escreva com mais detalhes

t+
cleber



Em 30/03/2012 10:51, Humberto Hazin escreveu:
Bom dia Benilton,

Obrigado por responder!

É o seguinte quando baixo a imagem ela já vem com esse número todo (S20040322004060) onde S=seawifs, em seguida vem o ano 2004032 2004060 significa o periodo da coleta do satélite ou seja 032-60 dias de 2004, ou seja mes 2. Assim para o outro arquivo S20040012004031 001-31 dias de 2004 ou seja mes 1

Esse arquivos estão em hdf4 porém preciso converter para hdf5 para poder trabalhar! Então criei uma função no R (hdf4to5) para para ler um executavel de um programa (H4H5TOOLS-2.2.1-win764-vs10static) em segundo plano para esse fim! Uso o pacote Satin para ler o arquivo convertido em hdf5 e fazer as extrações da área que quero ter esses dados "satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")" como preciso de quadrantes de 1x1 grau uso a função "simplifySat(m0401, extent=1)" em seguida criei uma função no R "extract(m0401)" para extrair tudo em coluna Lat, Long, Parametro...


hdf4to5("S20040012004031.hdf");m0401 <- satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")
 m0401<-(simplifySat(m0401, extent=1));m0401<-extract(m0401);m0401<-data.frame(m0401);m0401$mes<-1; m0401$year<-2004

 hdf4to5("S20040322004060.hdf");m0402 <- satinGet("S20040322004060.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")
 m0402<-(simplifySat(m0402, extent=1));m0402<-extract(m0402);m0402<-data.frame(m0402);m0402$mes<-2; m0402$year<-2004

Eu não sei se ficou mais claro agora!

Humberto


Em 3/29/2012 9:25 PM, Benilton Carvalho escreveu:
Sim, alguem pode te ajudar... mas depende muito de vc ajudar o alguem primeiro.... Qual o truque para sair de S20040322004060 para "mes 2"? (minha bola de cristal diz que o ano corresponde aos 4 primeiros digitos apos S, mas isso eh soh uma hipotese, jah que vc nao disse explicitamente)

b

2012/3/29 Humberto Hazin <hghazin@hotmail.com>
Prezados,

Venho mais uma vez pedir ajuda a voces para resolver um problema!

baixei uma série de images de satelite, por ano e mes (2004 a 2010) totalizando 163 arquivos ate ai tudo bem! Por termos de comodidade gostaria de criar um loop para nao ter que digitar essas 163 linhas ou mais para extrair latitude, longitude e SST. conforme o codigo abaixo:

hdf4to5("S20040012004031.hdf");m0401 <- satinGet("S20040012004031.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")
 m0401<-(simplifySat(m0401, extent=1));m0401<-extract(m0401);m0401<-data.frame(m0401);m0401$mes<-1; m0401$year<-2004

 hdf4to5("S20040322004060.hdf");m0402 <- satinGet("S20040322004060.hdf5",lats=c(10, -30), lons=c(-20, -50), itype="oceancolor")
 m0402<-(simplifySat(m0402, extent=1));m0402<-extract(m0402);m0402<-data.frame(m0402);m0402$mes<-2; m0402$year<-2004

Alguem poderia me ajudar!

Nao coloquei o arquivo pois é muito grande quase 36gigas porém caso precisem posso colocar o parte do codigo para baixarem um ou mais arquivos e testarem

Humberto