Você está se referindo à uma análise fatorial, de métodos multivariados? E as suas respostas (mais de uma) estão vinculadas a um plano experimental? Como você vai envolver as duas análises? Até onde sei a análise fatorial não incorpora informação de preditor linear pois assume que o vetor aleatório vem de uma mesma população. Por outro lado, a análise do experimento considera uma resposta por vez. Como combinar as duas coisas?

À disposição.

Walmes.