Júlio,

É necessário um CMR para sabermos como você esta declarando as datas (as.Date, as.POSIXct). Basicamente, tendo um y qualquer e um x no formato de data, a função plot() interpreta corretamente e faz o gráfico o espaçamento irregular. Para alguma inspiração veja

http://www.leg.ufpr.br/~walmes/ensino/ce223-2011-01/ce223-2011-01-aula22.R

À disposição.
Walmes.

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Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
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