Ei Cesar e Leonardo, Por algum motivo que eu não sei informar, a sugestão do Leonardo (que eu já havia tentado antes) não retorna todos os coeficientes. Repare que nessa sugestão apenas 3 coeficientes aparecem idade, mas fórmula possui 5 coeficentes. Aonde estão os outros dois? Não sei. A sugestão do César tambem não era bem o caminho que eu esperava e não retorna ou que eu gostaria que retornasse. Mas eu tive uma pequena luz com a sugestão do parse que foi fazer um
x <- deparse(Function(f)) class(x) "character"
Agora seria apenas editar a saida com estring e organizar como desejado. Mas eu ainda estou tendo dificuldades nesses passos porque os splits não presenrvam os + os - e os *. Então, me ocorreu que talvez eu pudesse olhar dentro da Function() pra ver o que ela faz e de onde ela tira esses coeficientes. Mas... Não estou conseguindo enxergar dentro da função.
Function function (object, ...) UseMethod("Function") <environment: namespace:Hmisc> Function.cph Error: object 'Function.cph' not found Function.rms Error: object 'Function.rms' not found
Alguma dica de como entender o que faz a Function.cph() Pedro Brasil Em 26 de abril de 2016 14:51, Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> escreveu:
Pedro,
Em síntese o que você deseja fazer é um /parsing/ da fórmula e exportá-la (na verdade os termos) para a planilha eletrônica.
IIRC não há um pacote ou função que o faça direta e completamente, mas um início saudável seria ir na linha deste post: http://stackoverflow.com/questions/10224805/how-to-select-a-part-of-formula-... .
HTH -- Cesar Rabak
2016-04-20 17:36 GMT-03:00 Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil < emmanuel.brasil@gmail.com>:
Amigos de R,
Ajustei um modelo de sobrevivencia e gostaria de exportar o modelo uma planilha xlsx ou csv, de tal forma que os coeficientes fiquem numa coluna e na coluna ao lado fique pelo o que o coeficiente está multiplicando. Já quebrei a cabeça aqui e não consegui. A pegadinha é que o modelo possui algumas transformações por splines e por isso preciso dos valores dos nós pra cada variável contínua. Achei uma função chamada Function que faz isso. Mas depois disso eu não avancei. Eu gostaria de pegar da saída função Function o que está entre as chaves, quebrar nos "+" e nos "-" pra separar os termos e depois quebrar nos "*" pra separar as colunas. Organizar em formato de planilha e exportar.
library(rms) n <- 1000 age <- 50 + 12*rnorm(n) label(age) <- "Age" sex <- factor(sample(c('Male','Female'), n, rep=TRUE, prob=c(.6, .4))) cens <- 15*runif(n) h <- .02*exp(.04*(age-50)+.8*(sex=='Female')) dt <- -log(runif(n))/h label(dt) <- 'Follow-up Time' e <- ifelse(dt <= cens,1,0) dt <- pmin(dt, cens) units(dt) <- "Year" dd <- datadist(age, sex) options(datadist='dd') S <- Surv(dt,e) f <- cph(S ~ rcs(age,4) + sex, x=TRUE, y=TRUE)
Function(f) function(age = 48.800654,sex = "Male") {0.28612987-0.017321951* age+0.00012586581*pmax(age-29.600456,0)^3-0.00046285671*pmax(age-44.273198,0)^3+0.00042111763*pmax(age-53.769262,0)^3-8.4126731e-05*pmax(age-69.855597,0)^3-0.64448916*(sex=="Male") } <environment: 0x0000000015fa7378>
Pra ficar mais ou menos assim +0.28612987 -0.017321951 age +0.00012586581 pmax(age-29.600456,0)^3 -0.00046285671 pmax(age-44.273198,0)^3 +0.00042111763 pmax(age-53.769262,0)^3 -8.4126731e-05 pmax(age-69.855597,0)^3 -0.64448916 (sex=="Male")
Alguma luz?
Abraço forte,
Pedro Brasil
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.