Caros Listeiros, Gostaria de criar uma matriz de contraste com vários níveis dentro de um fator, conforme o CRM abaixo, quando utilizo 3 níveis, funciona corretamente a função contrasts(), porém quando utilizo 4 ou mais níveis não funciona, alguém poderia me sugerir uma solução, Obrigado, #Dados artificiais colony<-as.factor(sort(rep(c("colony1", "colony2","colony3", "colony4"), 100))) y1 <- c(rnorm(100,1,0.1),rnorm(100,5,0.1),rnorm(100,3.5,0.1)) y2 <- c(rnorm(100,10,0.3),rnorm(100,11,0.6),rnorm(100,5,0.6)) y3 <- c(rnorm(100,10,2.3),rnorm(100,11,2.6),rnorm(100,11,2.5)) y4 <- c(rnorm(100,5,0.5),rnorm(100,7,0.5),rnorm(100,22,0.5)) y5 <- c(rnorm(100,11,0.1),rnorm(100,11,0.1),rnorm(100,11,0.1)) #Cria o data frame avaliacao <- as.factor(colony) espectro <- cbind(y1,y2,y3,y4,y5) dados <- data.frame(avaliacao = I(as.matrix(avaliacao)), bands = I(as.matrix(espectro))) ## Cria uma matriz de contraste ##Niveis levels(avaliacao) Xcontr <- contrMat(n=1:nlevels(avaliacao), type="Tukey") contrasts(avaliacao) <- Xcontr On 25/02/2015 13:09, walmes . wrote:
Considere o CMR abaixo.
da <- data.frame(col=gl(3,100, labels=c("A","B","C"))) da$y <- with(da, rnorm(length(col), mean=as.numeric(col), sd=1))
## Modelo com a restrição de não haver nível de referência, aqui estima ## a média de cada nível. m0 <- lm(y~0+col, data=da) summary(m0)
require(multcomp)
## Matriz de contrastes (lembrar de ter o 0 na formula!). Xcontr <- contrMat(n=1:nlevels(da$col), type="Tukey") str(Xcontr)
## Estimativa e erro padrão. Xcontr%*%coef(m0) sqrt(diag(Xcontr%*%vcov(m0)%*%t(Xcontr)))
## Via glht(). summary(glht(m0, linfct=mcp(col="Tukey")))
À disposição. Walmes.
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