Ha' rumores de que o ncdf para Windows nao esteja pronto para OPeNDAP... e eles (os rumores) parecem se confirmar, conforme mostro abaixo. Note que estou usando a (pen)ultima versao do R (aconselho voce usar sempre a ultima)... em Linux... Se, com a mesma versao do R e ncdf, vc nao conseguir... entao e', infelizmente, limitacao da versao Windows (o que eu sinceramente esperava nao acontecer). b
library(ncdf) dataset <- open.ncdf('http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000...') dataset [1] "file http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000... has 4 dimensions:" [1] "depth0 Size: 1" [1] "lat0 Size: 90" [1] "lon0 Size: 180" [1] "time0 Size: 1" [1] "------------------------" [1] "file http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000... has 1 variables:" [1] "float g_sea_water_temperature_at_sea_surface_skin[lon0,lat0,depth0,time0] Longname:Surface Skin Temperature Missval:1e+30" sessionInfo() R version 3.0.0 (2013-04-03) Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
locale: [1] LC_CTYPE=pt_BR.utf8 LC_NUMERIC=C [3] LC_TIME=pt_BR.utf8 LC_COLLATE=pt_BR.utf8 [5] LC_MONETARY=pt_BR.utf8 LC_MESSAGES=pt_BR.utf8 [7] LC_PAPER=C LC_NAME=C [9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C [11] LC_MEASUREMENT=pt_BR.utf8 LC_IDENTIFICATION=C attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base other attached packages: [1] ncdf_1.6.6 loaded via a namespace (and not attached): [1] tcltk_3.0.0 tools_3.0.0
Em 13 de junho de 2013 11:06, Heloíse Pavanato <helopavanato@gmail.com> escreveu:
Já tentei..não deu certo =/
Em 13 de junho de 2013 11:00, Rodrigo Plei <rodrigo.plei@gmail.com> escreveu:
Tente usar uma versão mais antiga do R também.
R.
Em 13 de junho de 2013 10:57, Heloíse Pavanato <helopavanato@gmail.com> escreveu:
Obrigada por todas as ajudas!
Eu baixei o ncdf4, mas não deu certo ler direto do link. Dai baixei o arquivo vinculado ao link opendap e então ele leu.
Ou seja, é possível ler .nc com no windows, mas não deu certo com o opendap. Outras pessoas tem lido do opendap com o pacote ncdf em Linux sem problemas..
Obrigada!
Att, Heloise
Em 13 de junho de 2013 09:51, Tito Conte <tito.conte@gmail.com> escreveu:
Heloíse verifique os seus pacotes do windows para netcdf
Tito Conte
2013/6/13 Thiago V. dos Santos <thi_veloso@yahoo.com.br>
Heloíse,
O pacote ncdf é antigo e deve ser descontinuado em breve. Instale o ncdf4 no lugar. Os binários para windows não existem no CRAN, mas estão disponíveis no site do autor: http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/. Esse pacote deve suportar o protocolo opendap.
Caso ele não suporte, uma solução temporária é baixar o arquivo para testar localmente (download.file('url_to_file')), e em seguida escrever para os autores dos pacotes (incluindo o Robert Hijmans do raster) perguntando se eles têm algum plano de incluir o opendap em um futuro próximo.
Alternativamente, existe uma opção mais complicada de compilar o pacote gdal com suporte a opendap. Porém, não sei se isso pode ser feito em Windows.
Saudações, -- Thiago V. dos Santos PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/inde... Phone: (612) 323 9898 ________________________________ From: Heloíse Pavanato <helopavanato@gmail.com> To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Sent: Wednesday, June 12, 2013 9:45 PM Subject: [R-br] arquivo netcdf
Olá, Tenho tentado abrir um arquivo netcdf mas sem êxito. Tentei com o pacote ncdf para abrir um arquivo através de um link OPeNDAP dataset <- open.ncdf('http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000...') e através do RNetCDF dataset <- open.nc('http://dap.marinexplore.org/dap/u/911215431c07/02841d66-d38e-11e2-8d83-22000...') e sempre dá o Error in open.ncdf trying to open file.....
Estou trabalhando em ambiente Windows. Isso seria um problema? Alguém tem alguma dica para me dar?
Grata, Heloise
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Rodrigo Silvestre Martins, PhD Bolsista FAPESP Pós-Doutorado
Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq) Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B) Butantã - São Paulo/SP, Brasil 05508-900 Tel: +55 11 3091 6549 Email: rodrigo.plei@gmail.com ; ocersm@lycos.com; rsmartins@usp.br
CV Lattes: http://lattes.cnpq.br/5350064124902777
Google Scholar: http://scholar.google.com.br/citations?user=zX_EezEAAAAJ&hl=pt-BR
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