Olá Antonio,

A melhor solução que encontrei para resolver esse problema foi (deve haver outra forma melhor, mais funcionou):
library(vegan)
data(dune)
dis <- vegdist(dune)
cluc <- hclust(dis, "complete")
plot(cluc)
rect.hclust(cluc, 3)
grp <- cutree(cluc, 3)
grp

namesI<-c("I")
namesII<-c("II")
namesIII<-c("III")
legend(0.4,0.98,namesIII,cex=1.5,bty="n",bg ="white",col="white")
legend(5.2,0.98,namesI,cex=1.5,bty="n",bg ='white')
legend(14.2,0.98,namesII,cex=1.5,bty="n",bg ='white')

Um abraço

Humberto Hazin

Em 3/2/2012 8:02 AM, Antonio Silva escreveu:

Olá

Gostaria de saber se há como indicar no dendrograma, na altura do corte, o número referente ao grupo, como indicado em cutree.

Observei que em alguns dendrogramas que os grupos selecionados de acordo com um dado o nível de corte não seguem necessariamente uma ordem ascendente (grupo 3 pode não ser o terceiro da esquerda para direita).

Seria algo semelhante ao da figura https://www.crops.org/images/publications/cs/42/5/1584f4.jpeg

Por exemplo exemplo:

library(vegan)
data(dune)
dis <- vegdist(dune)
cluc <- hclust(dis, "complete")
plot(cluc)
rect.hclust(cluc, 3)
grp <- cutree(cluc, 3)
grp

Notem que o grupo com os objetos 17, 19, 11 e 18, posicionado a esquerda no dedrograma é o grupo de número 3, e o grupo com os objetos 1,2, ..., 7, representado no meio do dendrograma é o de número 1.

Eu gostaria que, no nível de corte, aparecesse no dendrograma, ao lado das barras verticais de cada cluster, a indicação 3, 1, 2.

Agradeço qualquer dica. Abraços

Antônio

--
Antônio Olinto Ávila da Silva
Biólogo / Oceanógrafo

Instituto de Pesca

São Paulo, Brasil
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