Tipo, um numero corresponde um simbulo.
Por exemplo 19 é bolinha preta fechada
1 é bolinha com contorno preto e interior branco.
digita ?pch ou ?points que vai ter uma parte que fala qual numero faz cada simbulo.
então segundo seu exemplo vc deveria fazer algo como:
biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(rep(19,6),rep(1,6),rep(2,6))
ai no caso repete o valor 19 que é bolinha preta 6 vez que é sua primeira especies e assim vai.
a segunda especie vai ser bolinha aberta, que é o numero 1.
O vertor tem que ter o mesmo tamanho do numero de pontos que vai ter no grafico, numero de linhas no caso.
Acho que é mais ou menos isso :)
Em 7 de abril de 2011 22:01, Marcelo Claro de Souza
<marcelo_claro@yahoo.com.br> escreveu:
Walmes,
Eu sou bem novato em R e não entendi direito.
No caso eu devo usar da seguinte forma por exemplo: biplot(dados.pca,xlab="pc1",ylab="pc2", pch(1:7,8:14,15:21))
é mais ou menos isso que tenho de fazer?
Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza
Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP.
De: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>
Assunto: Re: [R-br] Simbolos pré-definidos em função das linhas de uma tabela
Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Data: Quinta-feira, 7 de Abril de 2011, 14:51
Marcelo,
O controle dos símbolos é com o argumento pch= {p}oint {ch}aracter dentro das funções gráficas. Em gráficos de dispersão, basta passar um vetor com os índices que identificam os símbolos. Para conhecer os símbolos faça
plot(1:30, pch=1:30)
Espero que no biplot() seja assim também. Caso não dê certo, forneça um exemplo reproduzível e destaque o erro para que possamos ajudar.
À disposição.
Walmes.
==========================================================================
Walmes Marques ZevianiLEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paranáfone: (+55) 41 3361 3573
VoIP: (3361 3600) 1053 1173e-mail: walmes@ufpr.br
twitter: @walmeszevianihomepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
linux user number: 531218==========================================================================
Em 7 de abril de 2011 13:44, Marcelo Claro de Souza <marcelo_claro@yahoo.com.br> escreveu:
Possuo um conjunto de dados composto por 21 linhas e 3 colunas.
Ao importar os dados eu utilizo o comando row.names e atribuo nome as linhas para facilitar a visualização das espécies na pca (no caso utilizo o pacote vegan e uso o comando rda(dados,scale=TRUE)
nesse conjunto de dados da linha 1 a 7 são plantas da mesma espécie, de 8 a 14 outra e de 16 a 21 a outra. Como eu faço p atribuir um símbolo único para cada espécie (ex: quadrado, circulo e triângulo) ao plotar um biplot?
Muito obrigado.
Marcelo Claro de Souza
Biólogo, Doutorando em Biologia Vegetal, Depto. de botânica, IBRC- UNESP.
|
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
-----Anexo incorporado-----
|
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
--
Grato
Augusto C. A. Ribas