Isso depende de que satélite e o grau de processamento da imagem. Se for do MODIS, por exemplo, você provavelmente precisará fazer um pré-processamento usando um software próprio: https://lpdaac.usgs.gov/tools/modis_reprojection_tool.

Se for imagem de algum outro satélite, você terá que pesquisar na documentação como (e se é preciso) fazer o pré-processamento. Tipicamente, esses softwares reprojetam a imagem bruta, pode calibrar seus números digitais (valor de pixel) e a salvam em um formato mais popular, como .tif ou .nc.

Caso você tenha certeza que a sua imagem já tenha sido processada, o pacote raster pode abri-la com facilidade (desde que o pacote rgdal, que fornece o driver gdal, também esteja instalado):

install.packages('rgdal')

install.packages('raster')

library(raster)

r <- raster('seuarquivo.hdf5')

plot(r)

Saudações,
--
Thiago V. dos Santos
PhD student
Land and Atmospheric Science
University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/index.htm
Phone: (612) 323 9898

From: Tito Conte <tito.conte@gmail.com>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Sent: Tuesday, August 6, 2013 2:26 PM
Subject: [R-br] Arquivos hdf

Caros, estou processadno arquivos de imagens de satélite e muitos deles vem em formto .hdf,

alguns de vocês faz ideia de como abri-los (o pacote hdf5, foi testado exaustivamente e não tive bons resultados)

Tito Conte

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