Quando uso o Atualizador de programas para atualizar o R ele me retorna a seguinte mensagem:"Verifique se você está utilizando repositórios de terceiros. Se estiver, desabilite-os, já que normalmente são fonte de problemas.Além disso, execute o seguinte comando em um Terminal: apt-get install -f"Rodo o comando 'apt-get install -f' no terminal e ele retorna o seguinte:"luciano@luciano:~$ apt-get install -fE: Não foi possível abrir arquivo de trava /var/lib/dpkg/lock - open (13: Permissão negada)E: Não foi possível criar acesso exclusivo ao directório de administração (/var/lib/dpkg/), é root?"já quando eu tento instalar o pacote 'vegan'Veja o que acontece:> install.packages('vegan') Installing package into ‘/home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0’ (as ‘lib’ is unspecified) tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/vegan_2.0-9.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 1939696 bytes (1.8 Mb) URL aberta ================================================== downloaded 1.8 Mb * installing *source* package ‘vegan’ ... ** package ‘vegan’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs gfortran -fpic -O3 -pipe -g -c cepin.f -o cepin.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c data2hill.c -o data2hill.o gfortran -fpic -O3 -pipe -g -c decorana.f -o decorana.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c goffactor.c -o goffactor.o gfortran -fpic -O3 -pipe -g -c monoMDS.f -o monoMDS.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c nestedness.c -o nestedness.o gfortran -fpic -O3 -pipe -g -c ordering.f -o ordering.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c pnpoly.c -o pnpoly.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c stepacross.c -o stepacross.o gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O3 -pipe -g -c vegdist.c -o vegdist.o gcc -std=gnu99 -shared -o vegan.so cepin.o data2hill.o decorana.o goffactor.o monoMDS.o nestedness.o ordering.o pnpoly.o stepacross.o vegdist.o -lgfortran -lm -lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR installing to /home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/vegan/libs ** R ** data ** inst ** preparing package for lazy loading Error : package ‘lattice’ was built before R 3.0.0: please re-install it ERROR: lazy loading failed for package ‘vegan’ * removing ‘/home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/vegan’ Warning in install.packages : installation of package ‘vegan’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpBQbvDv/downloaded_packages’ok, tento instalar o lattice e mas o erro continua.Instalando o pacote lme4 o erro final é o seguinte:installing to /home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/libs ** R ** inst ** preparing package for lazy loading Error : package ‘codetools’ was built before R 3.0.0: please re-install it Error : unable to load R code in package ‘Rcpp’ ERROR: lazy loading failed for package ‘Rcpp’ * removing ‘/home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp’ Warning in install.packages : installation of package ‘Rcpp’ had non-zero exit status ERROR: dependency ‘Rcpp’ is not available for package ‘minqa’ * removing ‘/home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/minqa’ Warning in install.packages : installation of package ‘minqa’ had non-zero exit status ERROR: dependency ‘Rcpp’ is not available for package ‘RcppEigen’ * removing ‘/home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/RcppEigen’ Warning in install.packages : installation of package ‘RcppEigen’ had non-zero exit status ERROR: dependencies ‘minqa’, ‘Rcpp’, ‘RcppEigen’ are not available for package ‘lme4’ * removing ‘/home/luciano/R/i686-pc-linux-gnu-library/3.0/lme4’ Warning in install.packages : installation of package ‘lme4’ had non-zero exit status The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpBQbvDv/downloaded_packages’Abraços,Luciano
Em 28 de outubro de 2013 22:01, Daniel C Bezerra <danielcbezerra@gmail.com> escreveu:Qual o problema? O que aparece?2013/10/28 Luciano F. Sgarbi <luciano.f.sgarbi@gmail.com>
_______________________________________________Prezados,Sou novo no uso do OS linux e estou com problemas na atualização do R (versão 3.0.2) e na instalação de qualquer pacote no R. Meu sistema operacional é o UBUNTU 13.04, 32-bit.Se alguém puder dar uma força serei grato.Abraços,Luciano--Luciano F. Sgarbi
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