Obrigado pelo feedback Fernando,
1 - O loop de 999 vezes é para ajustar 999 modelos diferentes? Que parâmetro você altera em cada loop.
O loop em 999 é para a cada vez que é realizado um ajuste, extrair os novos coeficientes coef(mod_ND[[i]])[1] e coef(mod_ND[[i]])[2] e os coloca no novo ajuste e repete isso n vezes até que a iteração de algum ajuste seja =1. Então necessariamente não precisa rodar 999 vezes, coloquei um número alto, mas imagino que a iteração igual a 1 venha a surgir antes.
2- "porém a cada vez que realiza o loop eu gostaria de reciclar os start values através da modificação em coef(mod_ND[[i]])[1] e coef(mod_ND[[i]])[2]." . O que você quer dizer com "Reciclar" --> modificar para qual valores?
Reciclar é a cada novo ajuste utilizar como start values os coef(mod_ND[[i]])[1] e coef(mod_ND[[i]])[2] do ajuste anterior, a menos que a iteração seja igual a 1.
4- Explique melhor as interações: A condição para o loop parar é quando a iteração for igual a 1 para os dois modelos ( if (mod_ND[[z,c(finIter")]] <= ){ break } ## ).
Sim isso não consegui colocar como condição, mas eu queria para quando a iteração para os dois modelos fosse igual a 1, ou n modelos se houverem.
Baseada na sua resposta, que também eu não consegui ainda fazer funcionar, seria:
for(z in 1:999){
-- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 99686-6970 (VIVO) (+55) 65 3221-2674 (FIXO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 OrcID: orcid.org/0000-0001-8232-6722 - ResearcherID: A-5790-2016 Researchgate: www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10 LinkedIn: br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635 Mendeley:www.mendeley.com/profiles/alexandre-dos-santos6/ ======================================================================
Alexandre , Algumas de suas explicações não estão muito claras para mim.
1 - O loop de 999 vezes é para ajustar 999 modelos diferentes? Que parametro você altera em cada loop.
2- "porém a cada vez que realiza o loop eu gostaria de reciclar os start values através da modificação em coef(mod_ND[[i]])[1] e coef(mod_ND[[i]])[2]." . O que você quer dizer com "Reciclar" --> modificar para qual valores?
4- Explique melhor as interações: A condição para o loop parar é quando a iteração for igual a 1 para os dois modelos ( if (mod_ND[[z,c(finIter")]] <= ){ break } ## ).
Acredito que a solução final para seu problema passe pela seguinte abordagem. No entanto preciso de mais esclarecimentos para melhorar.
library(minpack.lm)library(plyr)
##Banco de dados
Feature<-sort(rep(c("A","B"),22))Age<-c(60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,27,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96)Diameter<-c(13.9,16.2,19.1,19.3,4.7,6.7,9.6,11.2,13.1,15.3,15.4,5.4,7,9.9,11.7,13.4,16.1,16.2,5.9,8.3,12.3,14.5,2.3,5.2,6.2,8.6,9.3,11.3,15.1,15.5,5,7,7.9,8.4,10.5,14,14,4.1,4.9,6,6.7,7.7,8,8.2)d<-dados <- data.frame(Feature,Age,Diameter)str(d)
# #Realizando os ajustes
modelo<-function(dados){
}
list_modelos <- dlply(d,.(Feature),modelo)
list_modelos
On Apr 25 2019, at 10:53 am, ASANTOS por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:Prezados Membros,
Gostaria de fazer um loop (999 vezes) para ajustar dois modelos nls(Diameter ~ a1 * Age^a2) à partir de um subset em função da minhavariável Feature, porém a cada vez que realiza o loop eu gostaria dereciclar os start values através da modificação em coef(mod_ND[[i]])[1]e coef(mod_ND[[i]])[2]. A condição para o loop parar é quando aiteração for igual a 1 para os dois modelos ( if(mod_ND[[z,c(finIter")]] <= 1){ break } ## ). Bom, mas infelizmente nãoesta funcionando não, alguma ideia? Segue CRM:
#Pacotelibrary(minpack.lm)
# Meu banco de dados onde tenho o Diameter das plantas em função deFeature e Age.Feature<-sort(rep(c("A","B"),22))Age<-c(60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,27,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96,27,36,48,60,72,88,96)Diameter<-c(13.9,16.2,19.1,19.3,4.7,6.7,9.6,11.2,13.1,15.3,15.4,5.4,7,9.9,11.7,13.4,16.1,16.2,5.9,8.3,12.3,14.5,2.3,5.2,6.2,8.6,9.3,11.3,15.1,15.5,5,7,7.9,8.4,10.5,14,14,4.1,4.9,6,6.7,7.7,8,8.2)d<-dados <- data.frame(Feature,Age,Diameter)str(d)
#Realizando os ajustes
e1<- Diameter ~ a1 * Age^a2Fecture_vec<-unique(d$Feature)mod_ND <- list() #List para salvar cada modelofor(i in 1:length(Fecture_vec)){d2 <- subset(d, d$Feature == Fecture_vec[i])mod_ND[[i]] <- nlsLM(e1, data = d2,start = list(a1 = 0.1, a2 = 10),control = nls.control(maxiter = 1000))Xs<-data.frame()for(z in 1:999){d2 <- subset(d, d$Feature == Fecture_vec[i])mod_ND[[z]] <- nlsLM(e1, data = d2,start = list(a1 = coef(mod_ND[[i]])[1], a2 = mod_ND[[i]])[2]),control = nls.control(maxiter = 1000))if (mod_ND[[z,c(finIter")]] <= 1){ break } ## Só para quandoiteração = 1print(summary(mod_ND[[z]]))}}#
Obrigado
--======================================================================Alexandre dos SantosProteção FlorestalIFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato GrossoCampus CáceresCaixa Postal 244Avenida dos Ramires, s/nBairro: Distrito IndustrialCáceres - MT CEP: 78.200-000Fone: (+55) 65 99686-6970 (VIVO) (+55) 65 3221-2674 (FIXO)OrcID: orcid.org/0000-0001-8232-6722 - ResearcherID: A-5790-2016Researchgate: www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10LinkedIn: br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635Mendeley:www.mendeley.com/profiles/alexandre-dos-santos6/======================================================================
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