Heloise

Em 25 de outubro de 2012 13:18, Humberto <hghazin@hotmail.com> escreveu:

Olá Andre, Ivan e Leonard

Muito obrigado pela ajuda! eu consegui dessa forma aqui! Porém no eixo dos x esta aperecendo numeros que se sobrepostos aos nomes das espécies que não estou conseguindo retirar. Alguem poderia me ajudar nesse sentido!

Gostei dessa alternativa do forestplot. Como faço para retirar esse background (cinza) do forestplot e adicionar a linha vertical no 1?

E mais uma vez obrigado a todos pela ajuda

tableMat1a é a tabela abaixo

Specie lci or uci 1 Bigeye tuna 0.0952 0.1293 0.176 2 Yellowfin tuna 0.0916 0.1255 0.172 3 Albacore 0.0913 0.1562 0.267 4 Swordfish 0.1311 0.1565 0.187 5 Sailfish 0.0368 0.0923 0.231 6 White marlim 0.1300 0.2161 0.359 7 Blue marlim 0.0738 0.1471 0.293 8 Blue shark 0.1303 0.1653 0.210 9 Crocodile shark 0.1123 0.1792 0.286 10 Pelagic stingray 0.1074 0.2052 0.392 11 Turtle oliva 0.1275 0.3802 1.134 12 Oceanic whitetip shark 0.1658 0.3788 0.866

par(mar=c(2, 8, 0, 0))
y.axis <- c(length(tableMat1a$or):1)
plot(tableMat1a$or,y.axis, type = "p", axes = F, xlab = "", ylab = "", pch = 19, cex = 1.2,
xlim = c(0,1.2), xaxs = "r", main = "")
segments(tableMat1a$lci, y.axis, tableMat1a$uci, y.axis, lwd = 1.5)
axis(1, at = seq(0,1.2,by=0.2), labels = NA, tick = T,
cex.axis = 1.2, mgp = c(2,.7,0))
axis(2, at = y.axis, label = tableMat1a$Specie, las = 1, tick = F, ,mgp = c(2,.6,0),cex.axis = 1.2)
segments(1,1,1,30,lty=1)

Em 10/25/2012 12:09 AM, Leonard de Assis escreveu:
Andre,

vi a pouco na lista do ggplot2 um script que pode ser o que voce procura.

# d is a data frame with 4 columns
# d$x gives variable names
# d$y gives center point
# d$ylo gives lower limits
# d$yhi gives upper limits
forestplot <- function(d, xlab="Odds Ratio", ylab="Study"){
require(ggplot2)
p <- ggplot(d, aes(x=x, y=y, ymin=ylo, ymax=yhi)) +
    geom_pointrange() +
    coord_flip() +
    geom_hline(aes(x=0), lty=2) +
    ylab(xlab) +
    xlab(ylab) #switch because of the coord_flip() above
return(p)
}

# Create some dummy data.
d <- data.frame(x = toupper(letters[1:10]),
                y = rnorm(10, .05, 0.1))
d <- transform(d, ylo = y-1/10, yhi=y+1/10)

forestplot(d)
[]s
Leonard de Assis
assis <dot> leonard <at> gmail <dot> com
Em 24/10/2012 23:55, andrebvs escreveu:
Olá Humberto!

Eu até começei a fazer o que estava querendo, porém, não consegui implementar os intervalos de confianças com as respectivas médias. Segue um script abaixo até onde cheguei, se alguém puder continuar e sanar sua dúvida, seria uma grande ajuda!

library(fields)
plot(xlim=c(0,1.8),5:10, bty='n',type="n",axes=F,xlab="Relative catchability",ylab="")
x <- seq(0.0,1.8,by=0.2)
y <- seq(5,14)
u <- 1
v <- 50

axis(1,lwd=2,at = x,labels = formatC(x, format="fg"))
abline(v = 1, col = "black",lty=1,lwd=2)
arrow.plot(x[6],y[6],v,u,arrow.ex=.4, length=.2, col='black', lwd=2)
arrow.plot(x[6],y[6],u-360,v-45,arrow.ex=.5, length=.2, col='black', lwd=2)

text(0,7,"Bigeye\nYellowfin tuna\nAlbacore\nSwordfish\nSailfish\nWhite marlim\nBlue marlim\nBlue shark\nCrocodile shark\nPelagic stingray\nTurtle oliva\nOceanic whitetip shark",cex = 0.8,adj=c(0,0))

text(1.1,5,"Species\nBigeye tuna\nYellowfin tuna\nAlbacore\nSwordfish\nSailfish\nWhite marlim\nBlue marlim\nBlue shark\nCrocodile shark\nPelagic stingray\nTurtle oliva\nOceanic whitetip shark",cex = 0.8,adj=c(0,0))

Att.

André Barbosa Ventura da Silva

Em 24/10/2012 20:38, Ivan Bezerra Allaman < ivanalaman@yahoo.com.br > escreveu:

Utilize as funções plot, segments e par para obter êxito! O link abaixo será útil também.

http://gallery.r-enthusiasts.com/

(S,f,P)

Allaman

\begin{signature}

<<>>=

Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman

Universidade Estadual de Santa Cruz

Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas

Ilhéus/BA - Brasil

Fone: +55 73 3680-5596

E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com

@

\end{signature}
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