Prezado Fernando,

Eu uso a versão SID e meu arquivo está assim:

# deb cdrom:[Debian GNU/Linux testing _Jessie_ - Official Snapshot amd64 DVD Binary-1 20141027-06:39]/ jessie contrib main

# deb cdrom:[Debian GNU/Linux testing _Jessie_ - Official Snapshot amd64 DVD Binary-1 20141027-06:39]/ jessie contrib main

deb http://debian.c3sl.ufpr.br/debian/ sid main contrib non-free
deb-src http://debian.c3sl.ufpr.br/debian/ sid main contrib non-free

deb http://security.debian.org/ stretch/updates main contrib
deb-src http://security.debian.org/ stretch/updates main contrib

# jessie-updates, previously known as 'volatile'
deb http://debian.c3sl.ufpr.br/debian/ stretch-updates main contrib
deb-src http://debian.c3sl.ufpr.br/debian/ stretch-updates main contrib

# jessie-backports, previously on backports.debian.org
# deb http://debian.c3sl.ufpr.br/debian/ testing-backports main contrib
# deb-src http://debian.c3sl.ufpr.br/debian/ testing-backports main contrib

Como podes ver, as linhas jessie-backports, estão comentadas. Não sei se é o caso, mas não tenho problemas em rodar o R, conforme relato abaixo, versão 3.2.3

rudiney@pampa:~$ R --version
R version 3.2.3 (2015-12-10) -- "Wooden Christmas-Tree"
Copyright (C) 2015 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.
You are welcome to redistribute it under the terms of the
GNU General Public License versions 2 or 3.
For more information about these matters see
http://www.gnu.org/licenses/.

Vamos tentando resolver, abraço!

Em 18 de dezembro de 2015 20:24, Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com> escreveu:
# deb cdrom:[Debian GNU/Linux 8.1.0 _Jessie_ - Official Multi-architecture amd64/i386 NETINST #1 20150606-18:40]/ jessie main 

# deb cdrom:[Debian GNU/Linux 8.1.0 _Jessie_ - Official Multi-architecture amd64/i386 NETINST #1 20150606-18:40]/ jessie main

#------------------------Debian Mirror--------------------------------------
deb http://ftp.br.debian.org/debian/ jessie main contrib non-free
deb-src http://ftp.br.debian.org/debian/ jessie main contrib non-free
#---------------------atualizações de sugurança------------------------------
deb http://security.debian.org/ jessie/updates main
deb-src http://security.debian.org/ jessie/updates main
#-------------jessie-updates, previously known as 'volatile'--------------
deb http://ftp.br.debian.org/debian/ jessie-updates main 
deb-src http://ftp.br.debian.org/debian/ jessie-updates main
#--------------------jessie-backports--------------------------
deb http://ftp.br.debian.org/debian/ jessie-backports main
deb-src http://ftp.br.debian.org/debian/ jessie-backports main
#--------------------R MIRROR--------------------------------------- 
deb http://nbcgib.uesc.br/mirrors/cran/bin/linux/debian jessie-cran3/


Em 18 de dezembro de 2015 20:19, Rudiney S Pereira <rudiney.s.pereira@gmail.com> escreveu:
Olá,

Como é seu arquivo sources.list?

Abç


Em sexta-feira, 18 de dezembro de 2015, Fernando Antonio de souza <nandodesouza@gmail.com> escreveu:
Oi Rudiney,

Sim, ja tentei e não funcionou.

Em 18 de dezembro de 2015 19:49, Rudiney S Pereira <rudiney.s.pereira@gmail.com> escreveu:

Boa noite!

Já tentou rodar o comando: apt-get -f install  ?

Em 18/12/2015 7:16 PM, "Fernando Antonio de souza" <nandodesouza@gmail.com> escreveu:
Caros colegas

 Uso um pc Debian jessie 64 bits. Meu sistema estava funcionando plenamente. após fazer a atualização do r para a recente versão 3.2.3 passei a receber a seguinte mensagem em meu sistema ao rodar o camando dpkg --configure -a no shell :

Erros foram encontrados durante o processamento de:
 r-base-core
 r-cran-boot
 r-cran-cluster
 r-cran-foreign
 r-cran-mass
 r-cran-kernsmooth
 r-cran-lattice
 r-cran-nlme
 r-cran-matrix
 r-cran-mgcv
 r-cran-survival
 r-cran-rpart
 r-cran-class
 r-cran-nnet
 r-cran-spatial
 r-cran-codetools
 r-recommended
 r-base
 r-base-dev
 r-base-html
E: Sub-process /usr/bin/dpkg returned an error code (1)

Isto é apenas o final, pois a saída é muito grande. Mas basicamente parece ser uma questão de dependências. Pelo que entendi está ocorrendo um problema ao instalar o pacote r-base-core que impede a instalação do r-base e assim dos demais:

f:~$ sudo dpkg --configure r-base-core
Configurando r-base-core (3.2.3-1~jessiecran.0) ...
dpkg: erro ao processar o pacote r-base-core (--configure):
 sub-processo script post-installation instalado retornou estado de saída de erro 10
A processar 'triggers' para menu (2.1.47) ...
Erros foram encontrados durante o processamento de:
 r-base-core

:~$ sudo dpkg --configure r-base
dpkg: problemas com dependências impedem a configuração de r-base:
 r-base depende de r-base-core (>= 3.2.3-1~jessiecran.0); porém:
  Pacote r-base-core não está configurado ainda.
 r-base depende de r-recommended (= 3.2.3-1~jessiecran.0); porém:
  Pacote r-recommended não está configurado ainda.

dpkg: erro ao processar o pacote r-base (--configure):
 problemas de dependência - deixando desconfigurado
Erros foram encontrados durante o processamento de:
 r-base

Eu ja fiz a remoção completa do R utilizando o synaptic e tentei reinstalar  e sempre volta a mesma coisa. Após reinstalar e digitar R no shell o sofware abriu com as seguintes messagens

Warning message:
package "methods" in options("defaultPackages") was not found
Error : .onLoad falhou em loadNamespace() para 'utils', detalhes:
  chamada: options(op.utils[toset])
  erro: valor inválido para 'editor'
Error : .onLoad falhou em loadNamespace() para 'utils', detalhes:
  chamada: options(op.utils[toset])
  erro: valor inválido para 'editor'
Além disso: Warning message:
package ‘utils’ in options("defaultPackages") was not found
Error : .onLoad falhou em loadNamespace() para 'utils', detalhes:
  chamada: options(op.utils[toset])
  erro: valor inválido para 'editor'
Além disso: Warning message:
package ‘stats’ in options("defaultPackages") was not found
Durante a inicialização - Warning message:
package ‘methods’ in options("defaultPackages") was not found

Alguém sabe como corrigir este problema. Eu ja procurei em vários foruns debian/ubuntu e ja tentei comandos como

apt-get install -f
apt-get clean
apt-get autoremove

etc

O que eu faço?


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