Outubro 2015 - R-br

[OFF -Tópic] Cotas em concursos para negros e índios!
by Andre Oliveira 12 Jun '49

12 Jun '49

Pessoal, tem um colegar meu que vou fazer um concurso ele é descendente de negro ele é pardo. Ele veio com a pergunta como provar que sou negro, pois, tem vagas reservada para negros e índios? Eu sinceramente não sei e não tenho ideia pois nunca tive esta curiosidade. O que de fato comprova sua raça? Algum documento? O que são usados em concursos para provar? obrigado André Oliveira Souza

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Legenda eixo X
by Luciano F. Sgarbi 10 Jun '49

10 Jun '49

Prezados, Estou tentando centralizar a legenda do eixo X em uma figura com vários gráficos. Estou conseguindo centralizar a legenda da linha inferior como no exemplo, mas as linhas do meio não. par(mfrow=c(2,2)) plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y1") plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y2") mtext(side=1,cex=2,line=-1.8,text="Variável Explanatória 1",outer=TRUE) ### o problema está aqui, pois a legenda desce para a parte inferior da figura. plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y1") plot(rnorm(100),xlab="",ylab="y2") mtext(side=1,cex=2,line=-1.8,text="Variável Explanatória 2",outer=TRUE)## Esse dá certo Alguém podia dar uma luz de como eu posso fazer isso? Abraços -- *Luciano F. Sgarbi* Mestrando em Ecologia e Evolução Laboratório de Ecologia de Insetos (sl. 222) Departamento de Ecologia Instituto de Ciências Biológicas - ICB 1 Universidade Federal de Goiás, campus II Goiânia-GO 74001-970 Brazil

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Estatísticas do R
by Andre Oliveira 26 Abr '16

26 Abr '16

Pessoal,preciso de estatísticas do R tais como nº de bibliotecas oficiais, pacotes que o R já vem na instalação. André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES

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Re: [R-br] Render {rmarkdown} não funciona em emacs
by Rafael Tieppo 13 Fev '16

13 Fev '16

Fernando, por acaso testei ontem o "render" com 'pandoc'. Aqui funcionou 100% para gerar o pdf. Só que rodei o comando 'render(xxx.Rmd , pdf)' de uma janela aberta no modo terminal fora do emacs. não testei de outro modo. Rafael Tieppo State University of Mato Grosso - Department of Agricultural Engineering site: http://www2.unemat.br/rafaeltieppo blog: https://sistemasagricolas.wordpress.com "Evite o desperdício: antes de imprimir pense na sua responsabilidade com o ambiente". On Monday, March 16, 2015 11:00 AM, "r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br> wrote: Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request(a)listas.c3sl.ufpr.br Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner(a)listas.c3sl.ufpr.br Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..." Tópicos de Hoje: 1. Render {rmarkdown} não funciona em emacs (Fernando Antonio de souza) 2. loop lento (Roney Fraga Souza) 3. RES: [R-brUso do laço for para impessão de mais de um arquivo gerado. (Mauro Sznelwar) 4. Re: RES: [R-brUso do laço for para impessão de mais de um arquivo gerado. (izi) 5. Re: loop lento (Daniel Batista Lemes) 6. Re: loop lento (Roney Fraga Souza) 7. Re: loop lento (Daniel Batista Lemes) 8. Chamada de Trabalhos - VIII Reunião da ABAVE (Leandro Marino) 9. RES: RES: [R-brUso do laço for para impessão de mais de um arquivo gerado. (Mauro Sznelwar) ---------------------------------------------------------------------- Message: 1 Date: Sun, 15 Mar 2015 12:57:45 -0300 From: Fernando Antonio de souza <nandodesouza(a)gmail.com> To: "r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br" <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] Render {rmarkdown} não funciona em emacs Message-ID: <CAFrWFskiv2-XGy0jo=4FdyqzRsh3xqFzeaQ-y1Gj1m8HPjgjEg(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Caros amigos Preciso rodar um arquivo *.rmd e gostaria de utilizar a função Render do pacote rmarkdown. Acontece que ao utilizá-la ela retorna a seguinte mensagem "Error: pandoc version 1.12.3 or higher is required and was not found." Eu já atualizee a versão do pandoc mas a mensagem continau. Fiz uma busca na internte e encontrei esta postagem do Walmes que teve o mesmo problema http://r.789695.n4.nabble.com/Apply-rmarkdown-render-outside-the-RStudio-do… Segundo o Walmes ele solucionou criando um soft-link. Sou usuário novo em linux. Como posso fazer isso? abraços -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150315/59c3c8e2/atta…> ------------------------------ Message: 2 Date: Sun, 15 Mar 2015 19:25:03 +0000 From: Roney Fraga Souza <roneyfraga(a)gmail.com> To: R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] loop lento Message-ID: <10C667AD-0A7A-425E-9D05-2CA56ACFE7D1(a)gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Olá pessoal, Eu tenho uma lista (ver2) composta por com 14 elementos, cada elemento é um data.frame() contendo as mesmas variáveis, o que varia é apenas a quantidade de linhas. Cada elemento da lista é um ano específico do data.frame(), exemplo, ver2[[1]] é o ano de 1977, ver2[[2]] é 1978, ver2[[3]] é 1979 até o último ano ver2[[14]] que é 1990. Nos data.frame() tenho informações sobre artigos científicos: nome (código que não se repete), grupo (extraído via processo de clusterização), PY (ano que o artigo foi publicado) e one (variável apenas com valor 1 que uso em outros procedimentos). Os data.frame() são cumulativos, no ano de 1978 estão todos os artigos publicados até 1978, em 1979 estão todos os artigos publicados até 1978 mais os artigos publicados em 1979, no em de 1990 estão todos os artigos publicados até 1990. O procedimento de clusterização é realizado de modo independente para cada ano, logo o artigo 'Baker, 1976, V4, P5' pode estar em grupos diferentes para cada ano. Quero saber a origem dos artigos que estão em um determinado grupo. Exemplo, grupo 1 de 1990, é composto por 100 artigos, desses 25 faziam parte do grupo 1 em 1989, 30 do grupo 2 em 1989, 35 do grupo 3 em 1989, e os 10 restantes eu não tenho interesse, pois, foram publicados no ano de 1990 logo não existim nos anos anteriores. Segue exemplo do resultado que eu obtenho o código atual: label qtde tm1.grupo tm1.ano t.grupo t.ano 1-2 6 1 1989 2 1990 2-1 5 2 1989 1 1990 3-1 3 3 1989 1 1990 4-5 3 4 1989 5 1990 5-4 2 5 1989 4 1990 6-9 2 6 1989 9 1990 7-6 2 7 1989 6 1990 8-8 2 8 1989 8 1990 9-10 2 9 1989 10 1990 qtde = quantidade de artigos em cada grupo tm1.grupo = ano t menos 1 determinado grupo tm1.ano = ano t menos 1 t.grupo = grupo t.ano = ano Para chegar a tal resultado eu utilizo o seguinte código: # ------------------------------ # início do código # ------------------------------ # baixar o arquivo 'ver2.rds' nesse link: # https://db.tt/13dT9XQI <https://db.tt/13dT9XQI> ver2 <- readRDS("~/Downloads/ver2.rds") grupo <- list() for(k in 2:length(ver2)){ grp <- sort(unique((ver2[[k-1]]$grupo))) ### qtde de grupos no ano t-1 grp2 <- sort(unique((ver2[[k]]$grupo))) ### qtde de grupos no ano t RES <- LAB <- list() for (i in grp) { for (j in grp2) { RES <- append(RES,list(length(intersect(ver2[[k-1]]$name[ver2[[k-1]]$grupo==i], ver2[[k]]$name[ver2[[k]]$grupo==j])))) LAB <- append(LAB, paste(i,j, sep='-')) } } grupo[[k]] <- data.frame(label=sapply(LAB, "["), qtde=sapply(RES, sum)) grupo[[k]] <- subset(grupo[[k]],qtde>0) grupo[[k]]$tm1.grupo <- as.numeric(gsub('-.*','',grupo[[k]]$label)) grupo[[k]]$tm1.ano <- as.numeric(max(ver2[[k]]$PY)-1) grupo[[k]]$t.grupo <- as.numeric(gsub('^.-','',grupo[[k]]$label)) grupo[[k]]$t.ano <- as.numeric(max(ver2[[k]]$PY)) } # grupo # ------------------------------ # fim do código # ------------------------------ Meu problema é: esse código funciona mas é muito lento, muito mesmo, inviabilizando sua aplicação para o volume de dados que trabalho no dia a dia. Alguém conhece uma forma mais rápida de fazer isso. Obs.: parte desse código foi contribuição de Eder Comunello através dessa lista, mas naquela altura o problema estava estruturado de outra forma. Abraço Roney -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150315/a40bddcd/atta…> ------------------------------ Message: 3 Date: Sun, 15 Mar 2015 20:43:09 -0300 From: "Mauro Sznelwar" <sznelwar(a)uol.com.br> To: <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] RES: [R-brUso do laço for para impessão de mais de um arquivo gerado. Message-ID: <00e001d05f79$cb0b2090$612161b0$(a)com.br> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Por que não estou conseguindo rodar? symbol<-c("XOM","AAPL", "DIS") getCSV <- function(symbol){ + URL <- paste0("http://chartapi.finance.yahoo.com/instrument/1.0/", symbol, "/chartdata;type=quote;range=1d/csv") + tab <- read.table(URL, sep = ",", dec = ".", skip = 17) + colnames(tab) <- paste(c("timestamp","close","high","low","open","volume"), 1:6, sep = "-") + rownames(tab) <- paste(symbol, 1:nrow(tab)) + SAIDA <- paste0("Dados",symbol,"yahoo20150312.txt") + write.table(tab, file = SAIDA, sep = ";", dec = ".", header = T) + } sapply(symbol, getCSV) Error in write.table(tab, file = SAIDA, sep = ";", dec = ".", header = T) : unused argument (header = T) Oi Luis, Assim fica bem mais elegante =) Muito obrigada pela dica! Queria aproveitar para perguntar se você saberia um jeito de obter do yahoo usando o R todos os tickers das companhias pertencentes ao NIKKEI, porque ao invés de escrever os 225 tickers no symbol, eu puxaria direto. Muito obrigada mais uma vez! Em 13 de março de 2015 09:50, Luis G. S. e Silva <lgsilvaesilva(a)gmail.com> escreveu: Michelle, Essa tarefa pode ser realizada eliminado os loops (for) e algumas linha também. Dá uma olhadinha no script abaixo. Abraço symbol<-c("XOM","AAPL", "DIS") getCSV <- function(symbol){ URL <- paste0("http://chartapi.finance.yahoo.com/instrument/1.0/", symbol, "/chartdata;type=quote;range=1d/csv") tab <- read.table(URL, sep = ",", dec = ".", skip = 17) colnames(tab) <- paste(c("timestamp","close","high","low","open","volume"), 1:6, sep = "-") rownames(tab) <- paste(symbol, 1:nrow(tab)) SAIDA <- paste0("Dados",symbol,"yahoo20150312.txt") write.table(tab, file = SAIDA, sep = ";", dec = ".", header = T) } sapply(symbol, getCSV) --- Este email foi escaneado pelo Avast antivírus. http://www.avast.com -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150315/88a0159d/atta…> ------------------------------ Message: 4 Date: Sun, 15 Mar 2015 21:27:02 -0300 From: izi <salah3.1416(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] RES: [R-brUso do laço for para impessão de mais de um arquivo gerado. Message-ID: <1426465622.4713.2.camel(a)gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="UTF-8" Retire o argumento <header = T> da função write.table ficando assim: write.table(tab, file = SAIDA, sep = ";", dec = ".") -- Salah Saudações! ------------------------------ Message: 5 Date: Sun, 15 Mar 2015 21:28:50 -0300 From: Daniel Batista Lemes <dlemes(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] loop lento Message-ID: <CAPa99wrNeQ8JZ_=d9Rn0B7GkauicANPgxKjehDmU3=7n_fL2Dw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Roney, Não sei teu conhecimento de programação(não uso R, mas sou programador) o que tu está fazendo é 3 loop, onde, me parece, que tu percorre toda a matriz todas as vezes, uma forma de otimizar o que tu está fazendo é não fazer aquele sort ali, tu pode organizar os dados forra do loop, porque aquilo diminui muito a performance. Não consegui ver o código, mas quem sabe tu posta ele aqui http://pastebin.com/ assim como código fica melhor de analisar. Me parece que tu esta usando esse código apenas para organizar os dados, se for isso, existe linguagens para eficientes para fazer isso(python é um exemplo) e ai tu usa o R só para fazer as análises estatísticas. Caso tu não conheça python e queira manter o R existem implementações com melhor performance como o pqR(http://www.pqr-project.org/) ou o fastr ( https://github.com/allr/fastr) Sei que não te ajudei muito, mas espero ter te dado um norte :D Daniel Lemes Em 15 de março de 2015 16:25, Roney Fraga Souza <roneyfraga(a)gmail.com> escreveu: > Olá pessoal, > > Eu tenho uma lista (ver2) composta por com 14 elementos, cada elemento é > um data.frame() contendo as mesmas variáveis, o que varia é apenas a > quantidade de linhas. Cada elemento da lista é um ano específico do > data.frame(), exemplo, ver2[[1]] é o ano de 1977, ver2[[2]] é 1978, > ver2[[3]] é 1979 até o último ano ver2[[14]] que é 1990. Nos data.frame() > tenho informações sobre artigos científicos: nome (código que não se > repete), grupo (extraído via processo de clusterização), PY (ano que o > artigo foi publicado) e one (variável apenas com valor 1 que uso em outros > procedimentos). Os data.frame() são cumulativos, no ano de 1978 estão todos > os artigos publicados até 1978, em 1979 estão todos os artigos publicados > até 1978 mais os artigos publicados em 1979, no em de 1990 estão todos os > artigos publicados até 1990. O procedimento de clusterização é realizado de > modo independente para cada ano, logo o artigo 'Baker, 1976, V4, P5' pode > estar em grupos diferentes para cada ano. > > Quero saber a origem dos artigos que estão em um determinado grupo. > Exemplo, grupo 1 de 1990, é composto por 100 artigos, desses 25 faziam > parte do grupo 1 em 1989, 30 do grupo 2 em 1989, 35 do grupo 3 em 1989, e > os 10 restantes eu não tenho interesse, pois, foram publicados no ano de > 1990 logo não existim nos anos anteriores. Segue exemplo do resultado que > eu obtenho o código atual: > > label qtde tm1.grupo tm1.ano t.grupo t.ano > 1-2 6 1 1989 2 1990 > 2-1 5 2 1989 1 1990 > 3-1 3 3 1989 1 1990 > 4-5 3 4 1989 5 1990 > 5-4 2 5 1989 4 1990 > 6-9 2 6 1989 9 1990 > 7-6 2 7 1989 6 1990 > 8-8 2 8 1989 8 1990 > 9-10 2 9 1989 10 1990 > > qtde = quantidade de artigos em cada grupo > tm1.grupo = ano t menos 1 determinado grupo > tm1.ano = ano t menos 1 > t.grupo = grupo > t.ano = ano > > Para chegar a tal resultado eu utilizo o seguinte código: > # ------------------------------ > # início do código > # ------------------------------ > > # baixar o arquivo 'ver2.rds' nesse link: > # https://db.tt/13dT9XQI > > ver2 <- readRDS("~/Downloads/ver2.rds") > > grupo <- list() > > for(k in 2:length(ver2)){ > grp <- sort(unique((ver2[[k-1]]$grupo))) ### qtde de grupos no ano t-1 > grp2 <- sort(unique((ver2[[k]]$grupo))) ### qtde de grupos no ano t > RES <- LAB <- list() > for (i in grp) { > for (j in grp2) { > RES <- > append(RES,list(length(intersect(ver2[[k-1]]$name[ver2[[k-1]]$grupo==i], > ver2[[k]]$name[ver2[[k]]$grupo==j])))) > LAB <- append(LAB, paste(i,j, sep='-')) > } > } > grupo[[k]] <- data.frame(label=sapply(LAB, "["), qtde=sapply(RES, sum)) > grupo[[k]] <- subset(grupo[[k]],qtde>0) > grupo[[k]]$tm1.grupo <- as.numeric(gsub('-.*','',grupo[[k]]$label)) > grupo[[k]]$tm1.ano <- as.numeric(max(ver2[[k]]$PY)-1) > grupo[[k]]$t.grupo <- as.numeric(gsub('^.-','',grupo[[k]]$label)) > grupo[[k]]$t.ano <- as.numeric(max(ver2[[k]]$PY)) > } > # grupo > # ------------------------------ > # fim do código > # ------------------------------ > > Meu problema é: esse código funciona mas é muito lento, muito mesmo, > inviabilizando sua aplicação para o volume de dados que trabalho no dia a > dia. Alguém conhece uma forma mais rápida de fazer isso. > > Obs.: parte desse código foi contribuição de Eder Comunello através dessa > lista, mas naquela altura o problema estava estruturado de outra forma. > > Abraço > Roney > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- @lemes_daniel -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150315/301f5b32/atta…> ------------------------------ Message: 6 Date: Mon, 16 Mar 2015 01:09:48 +0000 From: Roney Fraga Souza <roneyfraga(a)gmail.com> To: R-br <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] loop lento Message-ID: <3DA46750-883C-49E3-8F43-3D3D79625304(a)gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="windows-1252" Olá Daniel, obrigado pela ajuda! Sou economista sem estudo formal de algoritmo, daí a chance de fazer cagada é grande. Segue link do código: https://gist.github.com/roneyfraga/debb242d919d9fdb3412 <https://gist.github.com/roneyfraga/debb242d919d9fdb3412> Quanto ao sort(), eu preciso fazer ele dentro do primeiro loop, pois e feito um para cada ano e/ou data.frame(). Conversando no IRC freenode #R recomendaram eu substituir a ?append? pelo ?outer?, sendo a segunda uma função mais rápida. Vou tentar ir nesse caminho no primeiro momento, caso não tenho sucesso estou pensando em me aventurar na mundo de Julia. Abraço Roney -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150316/d6e9d207/atta…> ------------------------------ Message: 7 Date: Sun, 15 Mar 2015 23:54:10 -0300 From: Daniel Batista Lemes <dlemes(a)gmail.com> To: r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br Subject: Re: [R-br] loop lento Message-ID: <CAPa99wqAvLd9dLr7GsxQRT+AXRiq7fPYFSt5-piG5bxMNDYfuA(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" Bom a primeira coisa que eu faria era gerar um data.frame com os dados organizados, ai tu teria um loop separado para organizar os dados e depois poderia usar os outros, já te daria uma certa performance Em 15 de março de 2015 22:09, Roney Fraga Souza <roneyfraga(a)gmail.com> escreveu: > Olá Daniel, obrigado pela ajuda! > > Sou economista sem estudo formal de algoritmo, daí a chance de fazer > cagada é grande. Segue link do código: > https://gist.github.com/roneyfraga/debb242d919d9fdb3412 > > Quanto ao sort(), eu preciso fazer ele dentro do primeiro loop, pois e > feito um para cada ano e/ou data.frame(). > > Conversando no IRC freenode #R recomendaram eu substituir a ?append? pelo > ?outer?, sendo a segunda uma função mais rápida. Vou tentar ir nesse > caminho no primeiro momento, caso não tenho sucesso estou pensando em me > aventurar na mundo de Julia. > > Abraço > Roney > > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. > -- @lemes_daniel -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150315/f354ba5e/atta…> ------------------------------ Message: 8 Date: Wed, 11 Mar 2015 16:11:40 -0300 From: Leandro Marino <leandromarino(a)leandromarino.com.br> To: undisclosed-recipients:; Subject: [R-br] Chamada de Trabalhos - VIII Reunião da ABAVE Message-ID: <CAKSaaFnKY5K+u0mp8eqDUD3qZWWK3uF3Dpdr-_5OQVP8Ww3WJw(a)mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8" *VIII Reunião da ABAVE * *Avaliação de Larga Escala no Brasil: * *ensinamentos, aprendizagens e tendências* Florianópolis/SC ? 19 a 21 de agosto de 2015 A Diretoria e os membros da Diretoria Científica da ABAVE convocam os interessados a enviar os trabalhos originais, contendo resultados de suas atividades de pesquisa científica ou de execução de projetos de avaliação educacional tanto da educação básica, quanto da educação superior, para apresentação durante a reunião. O formato da reunião foi pensado para favorecer a discussão e troca de experiências. Os autores deverão submeter seus artigos em duas categorias: - *Apresentação oral:* Serão aceitos textos que apresentem pesquisas com conclusão parciais ou finais, abordando temáticas novas ou já estabelecidas na área de avaliação educacional, preferencialmente utilizando os dados disponíveis das avaliações educacionais em larga escala, que evidenciem elaboração teórica e rigor conceitual e metodológico na análise. - *Apresentação pôster: *Serão aceitos textos que apresentem projetos de pesquisa em andamento ou relatos de experiências na área de avaliação educacional. Os trabalhos deverão ser submetidos eletronicamente até 30 de março de 2015. Em breve serão divulgados os procedimentos para a submissão eletrônica dos trabalhos. No ato da submissão, os próprios autores deverão classificar o trabalho em uma das categorias: apresentação oral ou pôster. *Regras para Submissão de Trabalhos:* Os artigos que serão submetidos à análise devem conter as seguintes especificações: - Deve estar no formato PDF, na fonte Arial, corpo 12. - Os artigos podem ser escritos em português, espanhol ou inglês. - A página deverá ser configurada em papel A4, utilizando os seguintes parâmetros: margem superior 2,5 cm; inferior 2,5 cm; lateral esquerda 3,5 cm; lateral direita 2,5 cm. - O trabalho deve conter apenas o título no corpo do texto. NENHUMA informação de autoria deve ser inserida no texto do artigo ou do seu resumo. - A primeira página do artigo deverá conter APENAS as seguintes informações de identificação: 1. Título do texto 2. Nome do autor ? sigla da Instituição 3. Nome(s) do co/autor(es) ? sigla da(s) instituição(es) (quando houver) 4. Agência ou Instituição Financiadora (quando houver) *Para Apresentação Ora**l* ?O texto deve conter no máximo 20 páginas, incluindo resumo, figuras, diagramas,bibliografias e anexos. Colocar resumo em português com, no máximo, 200 palavras, terminado pelas palavras-chave, em negrito. ?As notas de rodapé, em caso de serem indispensáveis, devem ser colocadas no final dotrabalho, antes das referências bibliográficas. ?Os títulos das seções internas devem estar em negrito e posicionado à margemesquerda. ?As figuras e tabelas devem ter legendas e estas, como as referências, devem seguir opadrão ABNT. *Para Apresentação de Pôster* ? O texto deve conter no máximo 10 páginas, incluindo resumo, figuras, diagramas, bibliografias e anexos. ? Colocar resumo em português com, no máximo, 200 palavras, terminado pelas palavras-chave, em negrito. ? As notas de rodapé, em caso de serem indispensáveis, devem ser colocadas no final do trabalho, antes das referências bibliográficas. ? Os títulos das seções internas devem estar em negrito e posicionado à margem esquerda. ? As figuras e tabelas devem ter legendas e estas, como as referências, devem seguir o padrão ABNT. *Avaliação dos Trabalhos* ? Os artigos submetidos serão avaliados pelos membros da Diretoria Científica e por pareceristas ad hoc indicados pela Diretoria. ? Os trabalhos serão avaliados pelo método do double blind review, que possibilita a análise inominada dos artigos, garantindo a imparcialidade da avaliação. ? Serão selecionados, para a apresentação na VIII Reunião Anual da ABAVE, 50 trabalhos na categoria Apresentação Oral e 70 na categoria Pôster. ? Cabe à Comissão Científica a possibilidade de reclassificar o trabalho, a partir de critérios da natureza da pesquisa desenvolvida, como também por disponibilidade de espaço para alocação das sessões apresentação oral. *Datas Relevantes* ? 30 de março: data final para submissão de trabalhos completos, nas categorias apresentação oral e apresentação de pôster; ? 01 de abril a 15 de maio: julgamento dos trabalhos pela Comissão Científica; ? 20 de maio: Divulgação do resultado final sobre os trabalhos aprovados. *Outras Informações* ? Os artigos aprovados e apresentados serão publicados eletronicamente nos anais do evento no sítio da ABAVE. ? O autor que apresentará o artigo submetido deverá estar inscrito no evento para que o artigo seja considerado para apresentação. Outras Informações devem ser solicitadas à: Secretaria da ABAVE (21) 2103-9635 abave(a)abave.org.br -------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20150311/7d692d4c/atta…> ------------------------------ Message: 9 Date: Mon, 16 Mar 2015 11:13:46 -0300 From: "Mauro Sznelwar" <sznelwar(a)uol.com.br> To: <r-br(a)listas.c3sl.ufpr.br> Subject: [R-br] RES: RES: [R-brUso do laço for para impessão de mais de um arquivo gerado. Message-ID: <001a01d05ff3$6c6abad0$45403070$(a)com.br> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1" Muito obrigado pelo retorno,mas poderia me enviar o código fonte otimizado de novo, eu sem querer acabei acabei apagando. Retire o argumento <header = T> da função write.table ficando assim: write.table(tab, file = SAIDA, sep = ";", dec = ".") -- Salah Saudações! --- Este email foi escaneado pelo Avast antivírus. http://www.avast.com ------------------------------ Subject: Legenda do Digest _______________________________________________ R-br mailing list R-br(a)listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ------------------------------ Fim da Digest R-br, volume 51, assunto 17 *****************************************

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[OFF-TOPIC] Teste sobre funcionamento da lista
by Walmes Zeviani 11 Nov '15

11 Nov '15

Mensagem de teste para avaliar se voltou a funcionar o serviço de email que hospeda a lista de discussão. W. ======================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG - Laboratório de Estatística e Geoinformação [25.450418S 49.231759W] Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 linux user number: 531218 pages & profiles: http://www.leg.ufpr.br/~walmes | http://lattes.cnpq.br/4410617539281650 http://git.leg.ufpr.br/walmes | https://github.com/walmes https://www.mendeley.com/profiles/walmes-zeviani1/ ========================================================================

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Índice de concordância Kappa
by André Lucas de Oliveira Moreira 10 Nov '15

10 Nov '15

Olá pessoal, tudo bem? Aqui no trabalho, pela primeira vez me deparei com uma situação em que é necessário comparar a eficiência de técnicas que detectam que uma mesma espécie de parasita. A principio não sabia qual seria o melhor teste para verificar isso, mas me falaram pela primeira vez do kappa. Então tenho buscado sobre o assunto. Porém, nos livros que eu tive acesso fala disso muito rapidamente e não me deram segurança suficiente para executar no R e interpretar os resultados. Pensando que tenho resultados categóricos (presença e ausência dos parasitos para ambas técnicas), qual seria a melhor forma de analisar isso, melhor pacote e função? Também preciso do valor de p. Seria muito útil se alguém indicasse um tutorial e também algum material teórico que me dê mais segurança no uso desta técnica. Agradecido, André -- *MSc. André Lucas de O. Moreira* http://lattes.cnpq.br/7258065668864153 <http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas> http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas 79 8837-3562 79 9132-9093

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Teste de distribuição de erros tabajara
by ASANTOS 06 Nov '15

06 Nov '15

Prezados listeiros, Estou tentando criar uma função para testar a distribuição de erros de normal, poisson e binomial negativa por enquanto, porém não sei o que estou fazendo de errado na minha função e solicito a ajuda de vocês para conseguir achar o erro, segue CRM: ## Teste de distribuição de erros tabajara require(MASS) BD<-rpois(1000,10) ### Valores a serem testados Dist<-c("negative binomial","normal","Poisson") for(typeD in 1:Dist){ k <- fitdistr(BD,typeD[Dist]) par <- k$estimate size <- par[1]#Parametro mu <- par[2]#Média SD<-sd(BD) N <- length(BD) if (typeD[Dist]=='negative binomial'){ ### Para binomial negativa est <-N*dnbinom(BD,size=size,mu=mu) ## Estimativas fecdf <- ecdf(BD) ###ecdf- Função de distribuição cumulativa empírica knotsX <- knots(fecdf) emp <- fecdf(c(knotsX,Inf)) # Empírica chisq.test(table(emp),table(est),correct=TRUE) ##Teste Chi - Quadrado para valiar a significância da distribuição } if (typeD[Dist]=='normal'){ ### Para normal est <-N*dnorm(BD,mean=mu, sd=SD) ## Estimativas fecdf <- ecdf(BD) ###ecdf- Função de distribuição cumulativa empírica knotsX <- knots(fecdf) emp <- fecdf(c(knotsX,Inf)) # Empírica chisq.test(table(emp),table(est),correct=TRUE) ##Teste Chi - Quadrado para valiar a significância da distribuição } if (typeD[Dist]=='Poisson'){ ### Para Poisson est <-N*dpois(BD,lambda=mu) ## Estimativas fecdf <- ecdf(BD) ###ecdf- Função de distribuição cumulativa empírica knotsX <- knots(fecdf) emp <- fecdf(c(knotsX,Inf)) # Empírica chisq.test(table(emp),table(est),correct=TRUE) ##Teste Chi - Quadrado para valiar a significância da distribuição } } # Obrigado, -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos(a)cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 ======================================================================

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Modelo Regressão Beta Inflacionado
by Arlene Guimaraes Leite 31 Out '15

31 Out '15

Prezados, Ospina sugere a construção de bandas de confiança (envelopes) simuladas com o seguinte comando: #==== normal probability plots ==== envelope.BIc(fit, type="quantil", main="quantal residual") mas não estou conseguindo executá-lo no R. Para executar o modelo utilizei as seguintes bibliotecas: library(gamlss) library(gamlss.dist) library(gamlss.nl) library(gamlss.mx) library(gamlss.cens) library(gamlss.tr) library(foreign) library(sas7bdat) Alguém pode me ajudar? Att., Arlene

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Erro em Acesso ao Servidor - Pacote RCurl
by Paulo Nogueira Starzynski 29 Out '15

29 Out '15

Pessoal, estou desenvolvendo um programa que realiza login em um servidor e depois faz uma requisição POST. estava tudo funcionando bem durante o desenvolvimento até que começou a retornar "Internal Server Error: 500" ao fazer o POST. Porém, quando eu acesso via browser, tudo funciona direito. O fato de funcionar no browser indica necessariamente que o erro é no meu código, certo? devem faltar opções de controle no objeto curl... Meu código está abaixo, mas infelizmente não é reproduzĩvel porque o acesso ao servido não é público. Mesmo assim, se alguém com familiaridade em curl puder olhar e dar alguma idéia... testei configurar várias opções do curl e nada contronou esse erro 500. ----------- require(RCurl) #------------------------------------------ curl <- getCurlHandle() curlSetOpt( verbose = T, cookiejar = 'cookies.txt' , followlocation = TRUE , ssl.verifypeer = FALSE, useragent = 'Mozilla/5.0 (Windows NT 5.1) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/44.0.2403.157 Safari/537.36', curl = curl ) #------------------------------------------ # list parameters to pass to the website (pulled from the source html) your.username <- 'usuario' your.password <- 'senha' params <- list( 'txt_email' = your.username, 'txt_senha' = your.password) # Realiza Login no Servidor webAddr <- "http://hostname.br/dirname/ct_login.php" login <- postForm(webAddr, .params = params, curl = curl, style = 'POST') login [1] "1{Sucesso controller{Login efetuado" attr(,"Content-Type") charset "text/html" "ISO-8859-1" #------------------------------------------ # Realiza Busca webBuscaId <- "http://hostname.br/dirname/executa_busca.php" busca <- postForm(webBuscaId, .opts = list(httpheader = c('Content-Type' = 'application/json', ssl.verifypeer = FALSE)), .params = list('idConsulta' = '13678616F', 'adicPar' = 'formatoNulo'), curl = curl, style="POST") * Hostname was found in DNS cache * Trying 10.65.0.169... * Connected to xxxxxx.xxxxxx.xxx.br (10.65.0.169) port 80 (#3) > POST /xxxxx/executa_busca.php HTTP/1.1 User-Agent: Mozilla/5.0 (Windows NT 5.1) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chrome/44.0.2403.157 Safari/537.36 Host: xxxxx.xxxx.xxx.br Accept: */* Cookie: PHPSESSID=3dug68beqvmgpe0v19cc78a947 Content-Type: application/json ssl.verifypeer: FALSE Content-Length: 28 * upload completely sent off: 28 out of 28 bytes * HTTP 1.0, assume close after body < HTTP/1.0 500 Internal Server Error < Date: Thu, 29 Oct 2015 12:53:27 GMT < Server: Apache/2.2.15 (Red Hat) < X-Powered-By: PHP/5.3.3 < Expires: Thu, 19 Nov 1981 08:52:00 GMT < Cache-Control: no-store, no-cache, must-revalidate, post-check=0, pre-check=0 < Pragma: no-cache < Content-Length: 0 < Connection: close < Content-Type: text/html; charset=ISO-8859-1 < * Closing connection 3 Error: Internal Server Error > Abraços, Paulo

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Re: [R-br] Ajustes de modelos não-lineares em gases in vitro
by Adriele Giaretta Biase 28 Out '15

28 Out '15

Olá pessoal, eu enviei uma dúvida sobre qual melhor estrutura de correlação residual devo considerar num modelo não linear (logístico bicompartimental) para ajuste de dados com produção de gases in vitro, que possui uma alta dependência residual. Eu organizei melhor o script e os dados, em anexo (novo anexo), em que os dados que estão na planilha, a primeira coluna é o x variável independente representando o tempo. E o y são as mensurações de gases. Então a nova planilha está exatamente as informações no qual preciso obter o ajuste do conjunto. Tentei inserir algumas estruturas de correlação, mas não deu certo. Alguém sabe como devo ajustar esse conjunto de dados (qual melhor estrutura de correlação residual que posso considerar) usando modelos não lineares na função gnls? Adriele #----------------------------------------------------------------------- setwd('C:\\Users\\Adriele\\Desktop') gas<-read.csv("gases_lista_R.csv",sep = ",", header = TRUE) head(gas) attach(gas) #----------------------------------------------------------------------- # Ajuste usando o gnls #Ajuste do modelo exponencial -lote I considerando os erros independentes ( o que não ocorre!!) mod1 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas, start=c(a=1.1179, b=0.0562, c=-9.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod1) # quadro de estimativas # função para o cálculo do R2 R2 <- function(residuals, observed){ 1-(sum(residuals)^2)/sum((observed-mean(observed))^2) } R2(residuals(mod1), gas$y) residuosnI<-summary(mod1)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod1) hist(residuosnI) plot( ACF(mod1, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - AR() mod2 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corAR1(), start=c(a=0.78, b=0.06, c=-5.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod2) # quadro de estimativas R2(residuals(mod2), gas$y) residuosnI<-summary(mod2)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod2) hist(residuosnI) plot(x,mod2$residuals) plot(mod2) plot( ACF(mod2, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - AR() mod3 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corAR1(form=~x), start=c(a=0.78, b=0.06, c=-5.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod3) # quadro de estimativas R2(residuals(mod3), gas$y) residuosnI<-summary(mod3)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod3) hist(residuosnI) plot(x,mod3$residuals) plot( ACF(mod3, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - AR2() mod4 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corARMA(p=2,q=0), start=c(a=0.78, b=0.06, c=-5.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod4) # quadro de estimativas R2(residuals(mod4), gas$y) residuosnI<-summary(mod4)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod4) hist(residuosnI) plot( ACF(mod4, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - ARIMA(p=2,q=1) mod5 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corARMA(p=2,q=1), start=c(a=1.1179, b=0.0562, c=-9.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod5) # quadro de estimativas R2(residuals(mod5), gas$y) residuosnI<-summary(mod5)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod5) hist(residuosnI) plot( ACF(mod5, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - ARIMA(p=2,q=2) mod6 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corARMA(p=2,q=2), start=c(a=1.1179, b=0.0562, c=-9.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod6) # quadro de estimativas R2(residuals(mod6), gas$y) residuosnI<-summary(mod6)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod6) hist(residuosnI) plot( ACF(mod6, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - ARIMA(p=3,q=1) mod7 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corARMA(p=3,q=1), start=c(a=1.1179, b=0.0562, c=-9.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod7) # quadro de estimativas R2(residuals(mod7), gas$y) residuosnI<-summary(mod7)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod6) hist(residuosnI) plot( ACF(mod7, maxLag =24), alpha = 0.05 ) # ------------------------------------------------------------------------ # Ajuste do modelo Logístico 2 pool considerando - AR() a ordem das obsevações mod8 <- gnls(y ~ a/(1+exp(2+4*b*(c-x)))+d/(1+exp(2+4*e*(c-x))), data=gas,correlation=corAR1(form=~1), start=c(a=0.78, b=0.06, c=-5.5923, d=0.367, e=0.0226)) summary(mod8) # quadro de estimativas R2(residuals(mod8), gas$y) residuosnI<-summary(mod8)$resid shapiro.test(residuosnI) ks.test(rnorm(577),residuosnI) plot(mod6) hist(residuosnI) -- Adriele Giaretta Biase. Mestre em Estatística e Experimentação Agropecuária - UFLA. Doutoranda em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/ USP Contato: (19) 8861-0619.

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