Novembro 2011 - R-br

Ajuda para realizar post-hoc em Anova de Medidas repetidas.
by Augusto Ribas 25 Nov '11

25 Nov '11

Ola, pessoal eu estou apanhando aqui para conseguir realizar uma analise de contrastes pra poder dizer que os resultados do Dia 1 são iguais do Dia 2, ai so no Dia 3 começa a aumentar. Eu vi um exemplo usando a função gls do pacote nlme, mas não consegui reproduzir pra conseguir verificar o que falo acima. Se alguém puder indicar um tutorial ou algum texto não muito complicado sobre como avaliar contrastes para anova de medidas repetidas, muito me ajudaria. Segue um exemplo dos dados: #Criandos dados set.seed(1) Resposta<-c(rnorm(20,2),rnorm(10,5),rnorm(20,5),rnorm(10,8)) Perigo<-rep(c("Baixo","Alto"),each=30) Id<-c(rep(1:10,3),rep(11:20,3)) Dia<-rep(rep(1:3,each=10),2) dados<-data.frame(cbind(Perigo,Dia,Id,Resposta)) dados$Resposta<-as.numeric(levels(dados$Resposta))[dados$Resposta] #Olhando os dados com um grafico str(dados) library(lattice) xyplot(Resposta~Dia|Perigo,data=dados, pch=16, col="black", cex=1.3, strip=strip.custom(bg="white"),type=c("p","a"),scale=list(tck=c(1,0),alternating=1)) #Anova de medidas repetidas modelo<-aov(Resposta~Perigo*Dia+Error(Id),data=dados) summary(modelo) -- Grato Augusto C. A. Ribas Site Pessoal: http://augustoribas.heliohost.org Lattes: http://lattes.cnpq.br/7355685961127056

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Combinações de padrão específico
by Leonard de Assis 25 Nov '11

25 Nov '11

Estou com a seguinte situação: a <- letters[1:4] expand.grid(a,a) <- não serve pra mim, pois retorna os pares (a,a),(b,b), (c,c), (d,d) como combinações t(combn(a,2)) <- não serve pois retorna (a,b) mas não retorna (b,a) Preciso de algo q retorne um conjunto de pares como o expand.grid faz, mas excluindo as combinações repetidas (a com a, b com b, etc) Atualmente faço assim: (a <- letters[1:4]) (b <- expand.grid(a1=a,a2=a)) (final <- subset(b, a1 != a2)) alguma idéia melhor? Comandos entre parentesis para ilustrar o resultado -- []s Leonard de Assis assis<dot> leonard<at> gmail<dot> com

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Cada alteração em um vetor sum () em outro
by ASANTOS 25 Nov '11

25 Nov '11

Boa tarde pessoal, Estou com uma dúvida de programação, onde tenho dois vetores de dados onde gostaria de obter a soma do primeiro, a cada alteração do segundo, tentei fazer: cont<-rpois(1000,4)####Cria os dados parc<-rep(1:length(freq),each=2)###Cria um novo vetor dados<-cbind(freq, parc) head(dados) ###Aqui gostaria de fazer a soma de cont a cada alteração de parc, usando um loop, for(i in 1:length(dados)) ##poderia ate especificar algo como dados$parc[i]>parc[i]+1 ## mas o problema seria fazer a sum() dentro de dados$freq Alguém teria alguma sugestão, Obrigado -- Alexandre DOS SANTOS Engenheiro Florestal, Msc. Laboratório de Entomologia Florestal Departamento de Entomologia Universidade Federal de Lavras Caixa Postal 3037 37200-000 - Lavras - Minas Gerais - Brasil Tel: +55 35 92230304

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Problemas numericos
by Carolina Pena 24 Nov '11

24 Nov '11

Boa tarde, Estou lendo um arquivo "txt" no R que contém o seguinte número: 698.4. Porém ao utilizar o seguinte comando: formatC(bd$x, digits = 40, format = 'e') [1] "6.9839999999999997724181577396507236699108e+02" O número 698.4 aparece conforme mostrado acima. Eu gostaria que o R entendesse como sendo: 6.984000000000000000000000000000000000e+02 Isso está me causando problemas ao realizar transformações pois preciso de um grau muito alto de precisão. Alguém sabe por que isso acontece e se é possível resolver? Agradeço desde já, Carolina

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[OT] Distancias entre municipios
by Leandro Marino 24 Nov '11

24 Nov '11

Caros, Por acaso alguém sabe me dizer se existe em algum local uma tabela / matriz de distancias entre TODOS os municípios brasileiros? Estava precisando deste tipo de dado. Atenciosamente, Leandro Lins Marino Centro de Avaliação Fundação CESGRANRIO Rua Santa Alexandrina, 1011 - 2º andar Rio de Janeiro, RJ - CEP: 20261-903 ( (21) 2103-9600 R.:236 * <mailto:leandro@cesgranrio.org.br> leandro(a)cesgranrio.org.br P Antes de imprimir pense em sua responsabilidade e compromisso com o MEIO AMBIENTE Esta mensagem, incluindo seus anexos, pode conter informacoes privilegiadas e/ou de carater confidencial, nao podendo ser retransmitida sem autorizacao do remetente. Se voce nao e o destinatario ou pessoa autorizada a recebe-la, informamos que o seu uso, divulgacao, copia ou arquivamento sao proibidos. Portanto, se você recebeu esta mensagem por engano, por favor, nos informe respondendo imediatamente a este e-mail e em seguida apague-a.

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Versão R-2.14.0 no Ubunto
by Marcelo Cardoso mello 23 Nov '11

23 Nov '11

Ok, funcionou perfeitamente. Meu Ubunto é o 10.04 e usei lucid. Depois instalou os pacotes na nova versão. Obrigado. A ajuda das funções aparecem dentro do terminal. É possível fazer a ajuda aparecer em outra janela?

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[Dúvida] Erro na instalação do RMySQL
by Pedro Rafael 23 Nov '11

23 Nov '11

Configuration error: could not find the MySQL installation include and/or library directories. Manually specify the location of the MySQL libraries and the header files and re-run R CMD INSTALL. INSTRUCTIONS: Pessoal estou usando o Ubuntu 11.10 e instalei o MySQL e posteriormente tentei instalar o pacote RMySQL e ocorreu o seguinte erro. O que pode está havendo? 1. Define and export the 2 shell variables PKG_CPPFLAGS and PKG_LIBS to include the directory for header files (*.h) and libraries, for example (using Bourne shell syntax): export PKG_CPPFLAGS="-I<MySQL-include-dir>" export PKG_LIBS="-L<MySQL-lib-dir> -lmysqlclient" Re-run the R INSTALL command: R CMD INSTALL RMySQL_<version>.tar.gz 2. Alternatively, you may pass the configure arguments --with-mysql-dir=<base-dir> (distribution directory) or --with-mysql-inc=<base-inc> (where MySQL header files reside) --with-mysql-lib=<base-lib> (where MySQL libraries reside) in the call to R INSTALL --configure-args='...' R CMD INSTALL --configure-args='--with-mysql-dir=DIR' RMySQL_<version>.tar.gz ERROR: configuration failed for package ‘RMySQL’ * removing ‘/home/pedro/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/RMySQL -- Saudações, Pedro Rafael Diniz Marinho. Estatístico - Secretaria de Estado da Saúde - PB.

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Teste de Friedman
by Ivan Bezerra Allaman 22 Nov '11

22 Nov '11

A agricolae baseia-se no livro Practical Nonparametrics Statistics. W.J. Conover, 1999 e a pgirmess no livro Siegel & Castellan (1988) Non parametric statistics for the behavioural sciences. Infelizmente não tenho os livros para ver se há ou não diferenças entre metodologias adotas nestes livros. (S,f,P) Allaman \begin{signature} <<>>= Prof. Dr. Ivan Bezerra Allaman Universidade Estadual de Santa Cruz Departamento de Ciências Exatas e Tecnológicas Ilhéus/BA - Brasil Fone: +55 73 3680-5076 E-mail: ivanalaman@yahoo.com.br/ivanalaman@gmail.com @ \end{signature}

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ANN/MLP
by Edmar Alino 22 Nov '11

22 Nov '11

Srs, bom dia, Estou implementando ANN/MLP e gostaria de saber quais artigos embasaram o ANN/MLP no software R. Nao consegui achar citacoes. Grato desde ja! Atenciosamente, *Edmar Alino (12) 8111-4699*

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Teste de Friedman
by Fernanda Balbino 22 Nov '11

22 Nov '11

Olá, boa tarde! Estou tentando fazer o teste de friedman e utilizei duas ferramentas que o R oferece. Porém me dá resultados diferentes. Utilizei no pacote pgirmess o friedmanmc para comparação multipa e o R me deu o resultado em que em alguns casos não há diferença significativa. E utilizei do pacote agricolae o friedman que me dá como resposta que somente existem diferenças significativas. Alguém já utilizou algumas destas funções ou conhece para me explicar por que da diferença? A função friedmanmcdo pacote pgirmessme parece ser mais comleta. Muito obrigada. Fernanda Balbino.

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